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A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node ATERF-4
Type: Protein GRN ID: np05040 Name: ATERF-4
Annotation: ATERF-4, ERF4, RAP2.5, ATERF4 | ethylene responsive element binding factor 4
Gene Locus: AT3G15210
Transcription factor /
transcriptional regulator:		 transcription factor family AP2-EREBP
References:
  • Holt PE, Gibbs C. Congenital urinary incontinence in cats: a review of 19 cases. Vet Rec. 1992 May 16;130(20):437-42. PubMed PMID: 1621341.
 
Pathways: Ethylene 
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 257053_at    
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 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 ATERF-4  --  interacts with  --  ATBPM1; BPM1
3 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3
4 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR1
5 ATERF-4  --  interacts with  --  ATSAP18; SAP18
6 ATERF-4  --  is a member of  --  Family85, transcription factor gene
7 ATERF-4  --  interacts with  --  ATBPM1; BPM1  --  interacts with  --  CBF3
8 ATERF-4  --  interacts with  --  ATBPM1; BPM1  --  interacts with  --  RAV1
9 ATERF-4  --  interacts with  --  ATBPM1; BPM1  --  interacts with  --  ATBPM6; BPM6
10 ATERF-4  --  interacts with  --  ATBPM1; BPM1  --  interacts with  --  ATBPM5; BPM5
11 ATERF-4  --  interacts with  --  ATBPM1; BPM1  --  interacts with  --  ATBPM3; BPM3
12 ATERF-4  --  interacts with  --  ATBPM1; BPM1  --  interacts with  --  ATCUL3B; CUL3B
13 ATERF-4  --  interacts with  --  ATBPM1; BPM1  --  interacts with  --  ATCUL3; ATCUL3A; CUL3; CUL3A
14 ATERF-4  --  interacts with  --  ATBPM1; BPM1  --  interacts with  --  RAP2.4; WIND1
15 ATERF-4  --  interacts with  --  ATBPM1; BPM1  --  interacts with  --  RAP2.4
16 ATERF-4  --  interacts with  --  ATBPM1; BPM1  --  interacts with  --  ATMYB69; MYB69
17 ATERF-4  --  interacts with  --  ATBPM1; BPM1  --  interacts with  --  AtMYB56; MYB56
18 ATERF-4  --  interacts with  --  ATBPM1; BPM1  --  interacts with  --  ASML1; ATWRI1; WRI; WRI1
19 ATERF-4  --  interacts with  --  ATBPM1; BPM1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.84123) with  --  AT3G48760
20 ATERF-4  --  interacts with  --  ATBPM1; BPM1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.808783) with  --  AT5G44080
21 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AT5G63350
22 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  BBM
23 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AtMYB98; MYB98
24 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AT3G16350
25 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AXR2
26 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ATWRKY30; WRKY30
27 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ATMYB15; ATY19; MYB15
28 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AtMYB20; MYB20
29 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ATMYBL2; MYBL2
30 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  BZIP45
31 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AtMYB97; MYB97
32 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AT1G35560
33 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  TCP16
34 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ANAC055; ATNAC3; NAC055; NAC3
35 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AT2G38300
36 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  HAT1
37 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AT4G35610
38 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  TCP3
39 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  anac074; NAC074
40 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AT2G33550
41 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AT1G68670
42 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  IAA13
43 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ATMYB73; MYB73
44 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  SOC1
45 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  MEE35; TCP4
46 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ATMYB3R2; MYB3R-2; MYB3R2; PC-MYB2
47 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AT1G51120
48 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AT-HSFB2B; HSFB2B
49 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  IAA19
50 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AP2; FL1; FLO2
51 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  SPL1
52 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  bZIP23
53 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ATBZIP9; BZIP9; BZO2H2
54 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  IAA11
55 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AXR5
56 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ARF17
57 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  IAA10
58 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AT5G14970
59 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ARI1; ATARI1
60 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AT3G44630
61 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  EMF1
62 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  BEH4
63 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ATTKL; TKL
64 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AT5G55040
65 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  TOE2
66 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  RAP2.7; TOE1
67 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ARF9
68 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ARF2/ARF1-BP
69 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AXR3
70 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  IAA2
71 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  JAZ6
72 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  JAZ5
73 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ATMYB44
74 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AtMYB32; MYB32
75 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ATZFP11; ZFP11
76 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  STZ; ZAT10
77 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ATMYB7; ATY49; MYB7
78 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AT-HSFB1; ATHSF4; HSF4; HSFB1
79 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  AT1G25560
80 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  EPR1; RVE7
81 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  ASL39; LBD37
82 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  LBD41
83 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  NZZ; SPL
84 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  IAA27; PAP2
85 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR3  --  interacts with  --  IAA3
86 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  ATWRKY32; WRKY32
87 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  GATA9
88 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  CBF4; DREB1D
89 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  bZIP21; TGA9
90 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  NF-YC4
91 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  AT4G03250
92 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  AT3G12730
93 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  ATWRKY61; WRKY61
94 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  anac096; NAC096
95 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  AS1
96 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  AT1G80610
97 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  AT1G12120
98 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  AT4G32030
99 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  ATSUMO3; SUM3; SUMO 3; SUMO3
100 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  AFP4; TMAC2
101 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  AT2G36080
102 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  IAA18
103 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  AT1G30810
104 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  GATA18; HAN; MNP
105 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  MYB77
106 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  AtHsp90.2; ERD8; HSP81-2; HSP90.2
107 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR1  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2
108 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR1  --  is regulated by  --  JAI3
109 ATERF-4  --  interacts with  --  TPR1  --  is the target gene of  --  ath-miR5024-3p
110 ATERF-4  --  interacts with  --  ATSAP18; SAP18  --  interacts with  --  AGL15
111 ATERF-4  --  interacts with  --  ATSAP18; SAP18  --  interacts with  --  ATHD1; ATHDA19; HD1; HDA1; HDA19; RPD3A
112 ATERF-4  --  interacts with  --  ATSAP18; SAP18  --  interacts with  --  AT1G19330
113 ATERF-4  --  interacts with  --  ATSAP18; SAP18  --  interacts with  --  AT1G75060
114 ATERF-4  --  is a member of  --  Family85, transcription factor gene  --  regulates the expression of   --  ATCHS; CHS; TT4
115 ATERF-4  --  is a member of  --  Family85, transcription factor gene  --  regulates the expression of   --  ATFLS1; FLS; FLS1
116 ATERF-4  --  is a member of  --  Family85, transcription factor gene  --  regulates the expression of   --  CHI
117 ATERF-4  --  is a member of  --  Family85, transcription factor gene  --  regulates the expression of   --  ATMYB12; MYB12; PFG1
118 ATERF-4  --  is a member of  --  Family85, transcription factor gene  --  regulates the expression of   --  Family86, transcription factor gene
119 ATERF-4  --  is a member of  --  Family85, transcription factor gene  --  is regulated by  --  Family83, transcription factor gene
120 ATERF-4  --  is a member of  --  Family85, transcription factor gene  --  has family member  --  ATERF15
121 ATERF-4  --  is a member of  --  Family85, transcription factor gene  --  has family member  --  ATERF-2
122 ATERF-4  --  is a member of  --  Family85, transcription factor gene  --  has family member  --  ATERF-7
123 ATERF-4  --  is a member of  --  Family85, transcription factor gene  --  has family member  --  ATERF11
124 ATERF-4  --  is a member of  --  Family85, transcription factor gene  --  has family member  --  ATERF6
125 ATERF-4  --  is a member of  --  Family85, transcription factor gene  --  has family member  --  ATERF13
126 ATERF-4  --  is a member of  --  Family85, transcription factor gene  --  has family member  --  ATERF-8
127 ATERF-4  --  is a member of  --  Family85, transcription factor gene  --  has family member  --  ATERF10
128 ATERF-4  --  is a member of  --  Family85, transcription factor gene  --  has family member  --  ATERF-5
129 ATERF-4  --  is a member of  --  Family85, transcription factor gene  --  has family member  --  ATERF12
130 ATERF-4  --  is a member of  --  Family85, transcription factor gene  --  has family member  --  ATERF3
131 ATERF-4  --  is a member of  --  Family85, transcription factor gene  --  has family member  --  ERF104
132 ATERF-4  --  is a member of  --  Family85, transcription factor gene  --  has family member  --  ATERF-9
133 ATERF-4  --  is a member of  --  Family85, transcription factor gene  --  has family member  --  ATERF1
134 ATERF-4  --  is a member of  --  Family85, transcription factor gene  --  has family member  --  ATERF14
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

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