Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node RBK1
Type: Protein GRN ID: np37747 Name: RBK1
Annotation: RBK1 | ROP binding protein kinases 1
Gene Locus: AT5G10520
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 250443_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 RBK1  --  modify  --  NCRK
3 RBK1  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8
4 RBK1  --  modify  --  NCRK  --  interacts with  --  AT5G38990
5 RBK1  --  modify  --  NCRK  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.87531) with  --  ZIP3
6 RBK1  --  modify  --  NCRK  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.884062) with  --  CYP87A2
7 RBK1  --  modify  --  NCRK  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.853414) with  --  AT5G40510
8 RBK1  --  modify  --  NCRK  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.832532) with  --  AT5G54370
9 RBK1  --  modify  --  NCRK  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.947595) with  --  UGT72E2
10 RBK1  --  modify  --  NCRK  --  modify  --  ATRAB-F2A; ATRAB5A; ATRABF2A; RAB-F2A; RAB5A; RABF2A; RHA1
11 RBK1  --  modify  --  NCRK  --  is the target gene of  --  ath-miR4239
12 RBK1  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  interacts with  --  ATPUB14; PUB14
13 RBK1  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  CDPK6
14 RBK1  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  AT3G20530
15 RBK1  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  AtITPK4; ITPK4
16 RBK1  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  CST; CX32
17 RBK1  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  AtMYB110; MYB110
18 RBK1  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  ASK18; SK18
19 RBK1  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  AGL50
20 RBK1  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  BIM3
21 RBK1  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  CRCK2
22 RBK1  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  BZIP45
23 RBK1  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  AT2G31390
24 RBK1  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  AtbZIP67; DPBF2
25 RBK1  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  IMK2
26 RBK1  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  AGL15
27 RBK1  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  AT1G35460
28 RBK1  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  ATMPK18; MPK18
29 RBK1  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  AGL75
30 RBK1  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  AT2G38250
31 RBK1  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  PFK3
32 RBK1  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  ATMYB123; ATTT2; MYB123; TT2
33 RBK1  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  AtTCP11; TCP11
34 RBK1  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  AtMYB42; MYB42
35 RBK1  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  KAN; KAN1
36 RBK1  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  AT2G26695
37 RBK1  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  GATA24; TIFY2B; ZML1; ZML1
38 RBK1  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  AT2G45910
39 RBK1  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  AGL11; STK
40 RBK1  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  AT1G71450
41 RBK1  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  ANAC092; ATNAC2; ATNAC6; NAC2; NAC6; ORE1
42 RBK1  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  TRY
43 RBK1  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  W-BOX
44 RBK1  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  AGL49
45 RBK1  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  AT5G47390
46 RBK1  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  AT5G47660
47 RBK1  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  AT1G23220
48 RBK1  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  AtMYB103; MYB103
49 RBK1  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  AT2G34450
50 RBK1  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  is modified by  --  ATMKK3
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact