Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node AT1G20480
Type: Protein GRN ID: np15694 Name:
Annotation: AMP-dependent synthetase and ligase family protein [TCDB:2.A.7.12]
Gene Locus: AT1G20480
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 259569_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 AT1G20480  --  transport  --  Sugar
3 AT1G20480  --  transport  --  N-Acetylgalactosamine
4 AT1G20480  --  transport  --  Nucleotide
5 AT1G20480  --  transport  --  UDP-alpha-D-galactose
6 AT1G20480  --  transport  --  UDP-N-acetyl-alpha-D-glucosamine
7 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is product (in catalytic reaction) of  --  BGLU39; TGG3
8 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is product (in catalytic reaction) of  --  Thioglucoside
9 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is product (in catalytic reaction) of  --  tgg1/myrosinase 1
10 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is product (in catalytic reaction) of  --  tgg2/myrosinase 2
11 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is product (in catalytic reaction) of  --  BGLU36
12 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is product (in catalytic reaction) of  --  BGLU35; TGG5
13 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is product (in catalytic reaction) of  --  BGLU34; TGG4
14 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  PHT3;1
15 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  ZIFL1
16 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  AT5G13670
17 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  ABCG6
18 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  SULTR4;1
19 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  KEG
20 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  AAC2
21 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  AT5G11230
22 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  AT5G05820
23 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  AT5G05630
24 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  ALA1
25 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  ATCAT6; CAT6
26 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  ATCAX4; CAX4
27 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  LAX3
28 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  AT4G38510
29 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  AT4G38380
30 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  AT4G38350
31 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  AT4G38250
32 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  AT4G38050
33 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  ACA2
34 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  ATHMA1; HMA1
35 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  CDCP2; LEJ2
36 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  AT4G36790
37 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  AT4G36670
38 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  AT4G35940
39 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  ATCLC-E; CLC-E; CLCE
40 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  AT4G35335
41 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  TMT2
42 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  ATGLR3.2; ATGLUR2; GLR3.2; GLUR2
43 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  LHT7
44 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  PIP2;7; PIP3; PIP3A; SIMIP
45 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  CDCP1; LEJ1
46 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  KUP5
47 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  HMA6; PAA1
48 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  ABCI10; ATNAP13; EMB2751
49 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  ATZIP9; ZIP9
50 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  ATKC1; AtLKT1; KAT3; KC1
51 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  AT4G32530
52 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  AT4G32510
53 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  AKT5; KT5
54 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  ATBT1; EMB104; EMB42; SHS1
55 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  AT4G32390
56 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  AT4G32272
57 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  AT4G32140
58 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  AT4G32060
59 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  ATGLR2.4; GLR2.4
60 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  AT4G31600
61 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  ATCNGC9; CNGC9
62 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  AT4G30420
63 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  ATCNGC17; CNGC17
64 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  ABCE3; ATNAP15; NAP15
65 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  AHA2; HA2; PMA2
66 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  ATHMA3; HMA3
67 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  ATHMA2; HMA2
68 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  ACA10; ATACA10; CIF1
69 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  AT4G29140
70 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  AMT1;4
71 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  ABCB23; ATATM1; ATM1
72 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  ABCB24; ATATM2; ATM2
73 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  AAC3; ATAAC3
74 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  AT4G28040
75 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  ATMTM1; MTM1
76 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  ATOPT6; OPT6
77 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  AT4G27720
78 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  ABCG9
79 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  ATOPT5; OPT5
80 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  AT4G26180
81 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  ABCB2; PGP2
82 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  ABCG4
83 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  ATDTX35; DTX35; FFT
84 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  ABCB28; ATNAP8; NAP8
85 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  AT4G01450
86 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  AT1G79050
87 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  AT1G68650
88 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  AT1G50400
89 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  AT1G48510
90 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  HSL1
91 AT1G20480  --  transport  --  Sugar  --  is transported by  --  ATSBT5.2
92 AT1G20480  --  transport  --  Nucleotide  --  is product (in catalytic reaction) of  --  AT4G13720
93 AT1G20480  --  transport  --  Nucleotide  --  is product (in catalytic reaction) of  --  Nucleoside triphosphate
94 AT1G20480  --  transport  --  UDP-alpha-D-galactose  --  has product (in catalytic reaction)  --  alpha-D-Galactosyl-(1->4)-beta-D-galactosyl-(1->4)-beta-D-glucosyl-(1<->1)-ceramide
95 AT1G20480  --  transport  --  UDP-alpha-D-galactose  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATUGE2; UGE2
96 AT1G20480  --  transport  --  UDP-alpha-D-galactose  --  is product (in catalytic reaction) of  --  UGE5
97 AT1G20480  --  transport  --  UDP-alpha-D-galactose  --  is product (in catalytic reaction) of  --  REB1; RHD1; UGE4
98 AT1G20480  --  transport  --  UDP-alpha-D-galactose  --  is product (in catalytic reaction) of  --  UGE3
99 AT1G20480  --  transport  --  UDP-alpha-D-galactose  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATUGE1; UGE1
100 AT1G20480  --  transport  --  UDP-alpha-D-galactose  --  is product (in catalytic reaction) of  --  AT5G18200
101 AT1G20480  --  transport  --  UDP-alpha-D-galactose  --  is product (in catalytic reaction) of  --  alpha-D-Galactose 1-phosphate
102 AT1G20480  --  transport  --  UDP-alpha-D-galactose  --  is transported by  --  ATWAKL10; WAKL10
103 AT1G20480  --  transport  --  UDP-alpha-D-galactose  --  is transported by  --  AT1G76390
104 AT1G20480  --  transport  --  UDP-alpha-D-galactose  --  is transported by  --  PSD
105 AT1G20480  --  transport  --  UDP-alpha-D-galactose  --  is transported by  --  AtHrd1B; Hrd1B
106 AT1G20480  --  transport  --  UDP-alpha-D-galactose  --  is transported by  --  AT1G56720
107 AT1G20480  --  transport  --  UDP-alpha-D-galactose  --  is transported by  --  AT1G55930
108 AT1G20480  --  transport  --  UDP-alpha-D-galactose  --  is transported by  --  SRF6
109 AT1G20480  --  transport  --  UDP-alpha-D-galactose  --  is transported by  --  AT1G48900
110 AT1G20480  --  transport  --  UDP-alpha-D-galactose  --  is transported by  --  AT1G45170
111 AT1G20480  --  transport  --  UDP-alpha-D-galactose  --  is transported by  --  ALDH3H1; ALDH4
112 AT1G20480  --  transport  --  UDP-alpha-D-galactose  --  is transported by  --  AT1G33290
113 AT1G20480  --  transport  --  UDP-alpha-D-galactose  --  is transported by  --  EMB2733; ESP3
114 AT1G20480  --  transport  --  UDP-alpha-D-galactose  --  is transported by  --  ATRECQ2; MED34; RECQL2
115 AT1G20480  --  transport  --  UDP-alpha-D-galactose  --  is transported by  --  AT1G30455
116 AT1G20480  --  transport  --  UDP-alpha-D-galactose  --  is transported by  --  AT1G29720
117 AT1G20480  --  transport  --  UDP-alpha-D-galactose  --  is transported by  --  AT1G24030
118 AT1G20480  --  transport  --  UDP-alpha-D-galactose  --  is transported by  --  AT1G15850
119 AT1G20480  --  transport  --  UDP-alpha-D-galactose  --  is transported by  --  CP24; LHCB6
120 AT1G20480  --  transport  --  UDP-alpha-D-galactose  --  is transported by  --  RUS3
121 AT1G20480  --  transport  --  UDP-alpha-D-galactose  --  is transported by  --  SLAC1 CDI3
122 AT1G20480  --  transport  --  UDP-alpha-D-galactose  --  is transported by  --  AT1G07200
123 AT1G20480  --  transport  --  UDP-N-acetyl-alpha-D-glucosamine  --  has product (in catalytic reaction)  --  N-Acetyl-D-glucosaminyldiphosphodolichol
124 AT1G20480  --  transport  --  UDP-N-acetyl-alpha-D-glucosamine  --  has product (in catalytic reaction)  --  UMP
125 AT1G20480  --  transport  --  UDP-N-acetyl-alpha-D-glucosamine  --  has product (in catalytic reaction)  --  Undecaprenyl-diphospho-N-acetylmuramoyl-(N-acetylglucosamine)-L-alanyl-gamma-D-glutamyl-L-lysyl-D-alanyl-D-alanine
126 AT1G20480  --  transport  --  UDP-N-acetyl-alpha-D-glucosamine  --  has product (in catalytic reaction)  --  N-Acetyl-D-glucosaminylphosphatidylinositol
127 AT1G20480  --  transport  --  UDP-N-acetyl-alpha-D-glucosamine  --  has product (in catalytic reaction)  --  4-(N-Acetyl-beta-D-glucosaminyl)-beta-D-mannosyl-R
128 AT1G20480  --  transport  --  UDP-N-acetyl-alpha-D-glucosamine  --  has product (in catalytic reaction)  --  6-(2-[N-Acetyl-beta-D-glucosaminyl]-alpha-D-mannosyl)-beta-D-mannosyl-R
129 AT1G20480  --  transport  --  UDP-N-acetyl-alpha-D-glucosamine  --  has product (in catalytic reaction)  --  N-Acetyl-beta-D-glucosaminyl-1,2-alpha-D-mannosyl-1,3-(R1)-beta-D-mannosyl-R2
130 AT1G20480  --  transport  --  UDP-N-acetyl-alpha-D-glucosamine  --  has product (in catalytic reaction)  --  Acyl-carrier protein
131 AT1G20480  --  transport  --  UDP-N-acetyl-alpha-D-glucosamine  --  is product (in catalytic reaction) of  --  GlcNAc1pUT2
132 AT1G20480  --  transport  --  UDP-N-acetyl-alpha-D-glucosamine  --  is product (in catalytic reaction) of  --  N-Acetyl-alpha-D-glucosamine 1-phosphate
133 AT1G20480  --  transport  --  UDP-N-acetyl-alpha-D-glucosamine  --  is product (in catalytic reaction) of  --  UTP
134 AT1G20480  --  transport  --  UDP-N-acetyl-alpha-D-glucosamine  --  is product (in catalytic reaction) of  --  GlcNAc1pUT1
135 AT1G20480  --  transport  --  UDP-N-acetyl-alpha-D-glucosamine  --  is transported by  --  AT1G76530
136 AT1G20480  --  transport  --  UDP-N-acetyl-alpha-D-glucosamine  --  is transported by  --  AT1G76520
137 AT1G20480  --  transport  --  UDP-N-acetyl-alpha-D-glucosamine  --  is transported by  --  TEL2
138 AT1G20480  --  transport  --  UDP-N-acetyl-alpha-D-glucosamine  --  is transported by  --  AT1G20490
139 AT1G20480  --  transport  --  UDP-N-acetyl-alpha-D-glucosamine  --  is transported by  --  AT1G12450
140 AT1G20480  --  transport  --  UDP-N-acetyl-alpha-D-glucosamine  --  is transported by  --  AT1G06870
141 AT1G20480  --  transport  --  UDP-N-acetyl-alpha-D-glucosamine  --  is transported by  --  AT1G03670
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact