Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node AT1G49200
Type: Protein GRN ID: np14491 Name:
Annotation: RING/U-box superfamily protein
Gene Locus: AT1G49200
Transcription factor /
transcriptional regulator:		 transcription factor family C2H2
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 260770_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290
3 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G35460
4 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G47180
5 AT1G49200  --  interacts with  --  CRK39
6 AT1G49200  --  interacts with  --  ATGB2; ATRAB2C; ATRABB1B; GB2
7 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  CLI1; RPK2; TOAD2
8 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  FOLK
9 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  ATBCB; BCB; BCB; SAG14
10 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  ABCG12; AtABCG12; ATWBC12; CER5; D3; WBC12
11 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  BIR1
12 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  ATNRT1; B-1; CHL1; CHL1-1; NRT1; NRT1.1
13 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  ZF14; ZRZ
14 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  ABCG13
15 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  ATNRT1:2; NRT1:2; NTL1
16 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  AtRLP30; RLP30
17 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  FRK1
18 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  ATDTX1; DTX1; TX1
19 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  ANTR1; PHT4;1
20 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  AT2G26900
21 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  SFP1
22 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  ALS3
23 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  AAP3; ATAAP3
24 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  AT3G52640
25 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  AT5G55290
26 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  AT5G19130
27 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  AT1G80890
28 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  AT3G11810
29 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  AT1G15610
30 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  AT3G27770
31 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  AT2G29180
32 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  AtSWEET9; SWEET9
33 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  AtSWEET7; SWEET7
34 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  AT4G04750
35 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  ATSTP4; STP4
36 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  AT1G44960
37 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  AT5G61570
38 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  AT2G41820
39 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  AT1G67510
40 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  AT1G07550
41 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  AT4G37250
42 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  AT2G28960
43 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  AT5G43420
44 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  AT5G27210
45 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  AT3G59090
46 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  AT4G21570
47 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  AT3G08600
48 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  AT5G13400
49 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  AT1G64150
50 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  AT2G42770
51 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  AT1G11450
52 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  AT4G08300
53 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  AT1G08890
54 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  AT3G05150
55 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  ALF5
56 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  AT3G21690
57 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  AT2G04080
58 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  AT1G33100
59 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  AT2G01970
60 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  emb1273
61 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  DER1
62 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  CYP708A3
63 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  AT5G47530
64 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  ANK1; ATANK1
65 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  AT1G05640
66 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  AT5G51160
67 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  AT2G01680
68 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  AT5G11870
69 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  AT3G49190
70 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  ATNAP5; NAP5
71 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  ABCG16
72 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  AT5G41800
73 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  AT1G47670
74 AT1G49200  --  interacts with  --  AT1G27290  --  interacts with  --  AATL2; ATLHT2; LHT2
75 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G35460  --  interacts with  --  DiT1
76 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G35460  --  interacts with  --  ATCESA3
77 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G35460  --  interacts with  --  BOI; RING
78 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G35460  --  interacts with  --  PIP1;3; PIP1C; TMP-B
79 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G35460  --  interacts with  --  HSL2
80 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G35460  --  interacts with  --  ADS2; DS2
81 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G35460  --  interacts with  --  AT1G66760
82 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G35460  --  interacts with  --  NDH18
83 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G35460  --  interacts with  --  AT1G21940
84 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G35460  --  interacts with  --  AT2G21237
85 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G35460  --  interacts with  --  AT4G30845
86 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G35460  --  interacts with  --  AT5G19570
87 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G35460  --  interacts with  --  AT1G15900
88 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G35460  --  interacts with  --  APE1
89 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G35460  --  interacts with  --  AT3G62400
90 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G35460  --  interacts with  --  SVL4
91 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G35460  --  interacts with  --  AT5G49760
92 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G35460  --  interacts with  --  AT2G37050
93 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G35460  --  interacts with  --  ATCRR2; CCR2
94 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G35460  --  interacts with  --  AT4G30660
95 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G35460  --  interacts with  --  AT1G04960
96 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G35460  --  interacts with  --  ATMLO5; MLO5
97 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G35460  --  interacts with  --  AT1G15150
98 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G35460  --  interacts with  --  AT5G49130
99 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G35460  --  interacts with  --  AT3G08930
100 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G35460  --  interacts with  --  AT1G54320
101 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G35460  --  interacts with  --  AT1G03730
102 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G35460  --  interacts with  --  AT5G10840
103 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G35460  --  interacts with  --  AT5G07475
104 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G35460  --  interacts with  --  AT5G05820
105 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G35460  --  interacts with  --  AT1G12500
106 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G35460  --  interacts with  --  DAD2
107 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G35460  --  interacts with  --  AT2G42390
108 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G35460  --  interacts with  --  AT5G42370
109 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G35460  --  interacts with  --  AGP16; ATAGP16
110 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G47180  --  transport  --  Phospholipid
111 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G47180  --  interacts with  --  ATELP; ATELP1; ATVSR1; BP-80; BP80; BP80-1;1; BP80B; GFS1; VSR1; VSR1;1
112 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G47180  --  interacts with  --  ESL1
113 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G47180  --  interacts with  --  FEI2
114 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G47180  --  interacts with  --  ALMT1; ATALMT1
115 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G47180  --  interacts with  --  EVR; SOBIR1
116 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G47180  --  interacts with  --  AtPERK5; PERK5
117 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G47180  --  interacts with  --  CRK19
118 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G47180  --  interacts with  --  AT4G37220
119 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G47180  --  interacts with  --  PIP2;7; PIP3; PIP3A; SIMIP
120 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G47180  --  interacts with  --  ATPLC9; PLC9
121 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G47180  --  interacts with  --  AtIPCS2
122 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G47180  --  interacts with  --  ATCDF1; ATMTP1; MTP1; ZAT; ZAT1
123 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G47180  --  interacts with  --  AT3G53810
124 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G47180  --  interacts with  --  AT5G40640
125 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G47180  --  interacts with  --  AT3G42725
126 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G47180  --  interacts with  --  AT5G57345
127 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G47180  --  interacts with  --  AT3G13950
128 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G47180  --  interacts with  --  AT2G41610
129 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G47180  --  interacts with  --  AT1G31130
130 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G47180  --  interacts with  --  AT4G20390
131 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G47180  --  interacts with  --  AT1G34470
132 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G47180  --  interacts with  --  AT2G29250
133 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G47180  --  interacts with  --  AT1G08590
134 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G47180  --  interacts with  --  AT3G59740
135 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G47180  --  interacts with  --  AT2G26730
136 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G47180  --  interacts with  --  AT5G16900
137 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G47180  --  interacts with  --  SRF8
138 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G47180  --  interacts with  --  AT4G20450
139 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G47180  --  interacts with  --  SRF1
140 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G47180  --  interacts with  --  AT1G11330
141 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G47180  --  interacts with  --  AT1G74370
142 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G47180  --  interacts with  --  AT4G26580
143 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G47180  --  interacts with  --  AT1G51930
144 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G47180  --  interacts with  --  AT2G38510
145 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G47180  --  interacts with  --  AT2G22180
146 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G47180  --  interacts with  --  AT5G48360
147 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G47180  --  interacts with  --  AT3G07540
148 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G47180  --  interacts with  --  AT3G07680
149 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G47180  --  interacts with  --  AT3G50120
150 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G47180  --  interacts with  --  AT4G18205
151 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G47180  --  interacts with  --  AT3G61750
152 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G47180  --  interacts with  --  PDLP8
153 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G47180  --  interacts with  --  AT5G19060
154 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G47180  --  interacts with  --  ATCLC-B; CLC-B
155 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G47180  --  interacts with  --  AT2G45670
156 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G47180  --  interacts with  --  AT5G15500
157 AT1G49200  --  interacts with  --  AT5G47180  --  interacts with  --  AT3G30390
158 AT1G49200  --  interacts with  --  CRK39  --  interacts with  --  AT4G11890
159 AT1G49200  --  interacts with  --  CRK39  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.818086) with  --  AT1G49750
160 AT1G49200  --  interacts with  --  CRK39  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.860974) with  --  AT1G06830
161 AT1G49200  --  interacts with  --  CRK39  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.854286) with  --  ATBG1; BGL1; BGLU18
162 AT1G49200  --  interacts with  --  CRK39  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.856767) with  --  WAK2
163 AT1G49200  --  interacts with  --  CRK39  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.810373) with  --  CXC750; ECS1
164 AT1G49200  --  interacts with  --  ATGB2; ATRAB2C; ATRABB1B; GB2  --  interacts with  --  ATRBOH D
165 AT1G49200  --  interacts with  --  ATGB2; ATRAB2C; ATRABB1B; GB2  --  interacts with  --  AT1G72300
166 AT1G49200  --  interacts with  --  ATGB2; ATRAB2C; ATRABB1B; GB2  --  interacts with  --  AT1G16000
167 AT1G49200  --  interacts with  --  ATGB2; ATRAB2C; ATRABB1B; GB2  --  interacts with  --  ATNPSN13; NPSN13
168 AT1G49200  --  interacts with  --  ATGB2; ATRAB2C; ATRABB1B; GB2  --  interacts with  --  AT2G16250
169 AT1G49200  --  interacts with  --  ATGB2; ATRAB2C; ATRABB1B; GB2  --  interacts with  --  AT4G31340
170 AT1G49200  --  interacts with  --  ATGB2; ATRAB2C; ATRABB1B; GB2  --  interacts with  --  AT2G36840
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact