Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node AT1G27700
Type: Protein GRN ID: np13805 Name:
Annotation: Syntaxin/t-SNARE family protein
Gene Locus: AT1G27700
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 261649_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 AT1G27700  --  interacts with  --  DER1
3 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12
4 AT1G27700  --  interacts with  --  APG9; ATAPG9
5 AT1G27700  --  interacts with  --  DER1  --  interacts with  --  AT1G27290
6 AT1G27700  --  interacts with  --  DER1  --  interacts with  --  AT5G63030
7 AT1G27700  --  interacts with  --  DER1  --  interacts with  --  AT5G62710
8 AT1G27700  --  interacts with  --  DER1  --  interacts with  --  AT1G30320
9 AT1G27700  --  interacts with  --  DER1  --  interacts with  --  ATMAPR3; ATMP2; MAPR3; MSBP2
10 AT1G27700  --  interacts with  --  DER1  --  interacts with  --  CYP71B6
11 AT1G27700  --  interacts with  --  DER1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2
12 AT1G27700  --  interacts with  --  DER1  --  interacts with  --  FOLK
13 AT1G27700  --  interacts with  --  DER1  --  interacts with  --  ATVAMP722; SAR1; VAMP722
14 AT1G27700  --  interacts with  --  DER1  --  interacts with  --  ATMEMB12; MEMB12
15 AT1G27700  --  interacts with  --  DER1  --  interacts with  --  PHF1
16 AT1G27700  --  interacts with  --  DER1  --  interacts with  --  ATPPT2; PPT2
17 AT1G27700  --  interacts with  --  DER1  --  interacts with  --  AT4G17680
18 AT1G27700  --  interacts with  --  DER1  --  interacts with  --  KAT1
19 AT1G27700  --  interacts with  --  DER1  --  interacts with  --  ABCG6
20 AT1G27700  --  interacts with  --  DER1  --  interacts with  --  AT3G52640
21 AT1G27700  --  interacts with  --  DER1  --  interacts with  --  ATVAMP723; VAMP723; VAMP723
22 AT1G27700  --  interacts with  --  DER1  --  interacts with  --  ATNPSN13; NPSN13
23 AT1G27700  --  interacts with  --  DER1  --  interacts with  --  SEC61 BETA
24 AT1G27700  --  interacts with  --  DER1  --  interacts with  --  AT5G24000
25 AT1G27700  --  interacts with  --  DER1  --  interacts with  --  AT5G67130
26 AT1G27700  --  interacts with  --  DER1  --  interacts with  --  AT1G01230
27 AT1G27700  --  interacts with  --  DER1  --  interacts with  --  AT1G69460
28 AT1G27700  --  interacts with  --  DER1  --  interacts with  --  DER2.2
29 AT1G27700  --  interacts with  --  DER1  --  interacts with  --  ABCG23
30 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.897527) with  --  MRL7-L
31 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.10894) with  --  AT1G76050
32 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.932398) with  --  PLSP1
33 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.956999) with  --  AT3G13180
34 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.921467) with  --  AT4G13220
35 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.89076) with  --  AT5G42765
36 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.943347) with  --  AT5G63040
37 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.971812) with  --  AT5G62840
38 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  AT4G00350
39 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  ELIP; ELIP1
40 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  AtCEST; CEST; Y3IP1
41 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  DiT1
42 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  AUX1
43 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  ALE2
44 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  ATBCB; BCB; BCB; SAG14
45 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  ATPTR5; PTR5
46 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  PIN4
47 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  ATPTR1; PTR1
48 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  AT4G37220
49 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  NRT1.7
50 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  AT1G50290
51 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  PIN6
52 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  ATFKBP42; FKBP42; TWD1; UCU2
53 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  ICME-LIKE2
54 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  AT5G55290
55 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  AT5G07490
56 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  AT1G15610
57 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  AT3G02420
58 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  AT2G41610
59 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  AT1G75810
60 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  AT4G23090
61 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  AtSWEET5; AtVEX1; SWEET5
62 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  AT1G44960
63 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  SRF2
64 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  AT1G27190
65 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  AT1G74370
66 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  AT4G30660
67 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  AT2G29020
68 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  AT5G27370
69 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  AT2G25310
70 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  AtVHP2;1; AVP2; AVPL1; VHP2;1; VP2
71 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  AT5G13400
72 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  AT1G62200
73 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  AT3G15710
74 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  ATMGT9; MGT9; MRS2-2
75 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  AT5G49130
76 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  AT4G14480
77 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  AT3G08930
78 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  AT4G35080
79 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  AT1G30080
80 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  ERD4
81 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  AT2G01970
82 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  AT1G14670
83 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  DAD2
84 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  PDLP8
85 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  AT1G68380
86 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  ATCNGC5; CNGC5
87 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  CLE26
88 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  AT5G42370
89 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  AT3G16510
90 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  AT5G15500
91 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  AGP16; ATAGP16
92 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  AT4G26770
93 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  AT4G19380
94 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  ABCG16
95 AT1G27700  --  interacts with  --  ABCI12  --  interacts with  --  AATL2; ATLHT2; LHT2
96 AT1G27700  --  interacts with  --  APG9; ATAPG9  --  interacts with  --  ATRBL15; RBL15
97 AT1G27700  --  interacts with  --  APG9; ATAPG9  --  interacts with  --  AT1G16790
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact