Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node SBH1
Type: Protein GRN ID: np13604 Name: SBH1
Annotation: SBH1 | sphingoid base hydroxylase 1 [EC:1.14.13.169]
Gene Locus: AT1G69640
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 260421_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 SBH1  --  has product (in catalytic reaction)  --  Phytosphingosine
3 SBH1  --  interacts with  --  RUS3
4 SBH1  --  interacts with  --  ESK1; TBL29
5 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2
6 SBH1  --  has product (in catalytic reaction)  --  Phytosphingosine  --  is product (in catalytic reaction) of  --  Sphinganine
7 SBH1  --  interacts with  --  RUS3  --  interacts with  --  ATBCB; BCB; BCB; SAG14
8 SBH1  --  interacts with  --  RUS3  --  interacts with  --  CYP707A2
9 SBH1  --  interacts with  --  RUS3  --  interacts with  --  PIP1;3; PIP1C; TMP-B
10 SBH1  --  interacts with  --  RUS3  --  interacts with  --  BIR1
11 SBH1  --  interacts with  --  RUS3  --  interacts with  --  AT3G52640
12 SBH1  --  interacts with  --  RUS3  --  interacts with  --  APE1
13 SBH1  --  interacts with  --  RUS3  --  interacts with  --  AT1G15610
14 SBH1  --  interacts with  --  RUS3  --  interacts with  --  TET15
15 SBH1  --  interacts with  --  RUS3  --  interacts with  --  TET2
16 SBH1  --  interacts with  --  RUS3  --  interacts with  --  SVL4
17 SBH1  --  interacts with  --  RUS3  --  interacts with  --  AT2G28960
18 SBH1  --  interacts with  --  RUS3  --  interacts with  --  AT1G74370
19 SBH1  --  interacts with  --  RUS3  --  interacts with  --  AT2G29020
20 SBH1  --  interacts with  --  RUS3  --  interacts with  --  AT5G27210
21 SBH1  --  interacts with  --  RUS3  --  interacts with  --  AT4G21570
22 SBH1  --  interacts with  --  RUS3  --  interacts with  --  AT1G01230
23 SBH1  --  interacts with  --  RUS3  --  interacts with  --  AT5G52050
24 SBH1  --  interacts with  --  RUS3  --  interacts with  --  AT3G08930
25 SBH1  --  interacts with  --  RUS3  --  interacts with  --  AT2G24170
26 SBH1  --  interacts with  --  RUS3  --  interacts with  --  AT5G05820
27 SBH1  --  interacts with  --  RUS3  --  interacts with  --  AT2G42390
28 SBH1  --  interacts with  --  RUS3  --  interacts with  --  AT5G11870
29 SBH1  --  interacts with  --  RUS3  --  interacts with  --  AT2G25890
30 SBH1  --  interacts with  --  RUS3  --  transport  --  Sugar phosphate
31 SBH1  --  interacts with  --  RUS3  --  transport  --  Sterol
32 SBH1  --  interacts with  --  RUS3  --  transport  --  D-Glucose 6-phosphate
33 SBH1  --  interacts with  --  RUS3  --  transport  --  Thiamin diphosphate
34 SBH1  --  interacts with  --  RUS3  --  transport  --  UDP-alpha-D-galactose
35 SBH1  --  interacts with  --  ESK1; TBL29  --  interacts with  --  ALE2
36 SBH1  --  interacts with  --  ESK1; TBL29  --  interacts with  --  AT1G11915
37 SBH1  --  interacts with  --  ESK1; TBL29  --  interacts with  --  AT5G43460
38 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  ATMAPR3; ATMP2; MAPR3; MSBP2
39 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  AT4G38690
40 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  AT4G12000
41 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  CYP81D8
42 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  AT5G50520
43 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  ELIP; ELIP1
44 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  ATRBOH D
45 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  ATGPT1; GPT1
46 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  ATHH2; PIP1;2; PIP1B; TMP-A
47 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  ATCESA3
48 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  ATELP; ATELP1; ATVSR1; BP-80; BP80; BP80-1;1; BP80B; GFS1; VSR1; VSR1;1
49 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  FOLK
50 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  ATUTR3; UTR3
51 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  CLT2
52 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  PIN4
53 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  PIP2;7; PIP3; PIP3A; SIMIP
54 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  AtRLP30; RLP30
55 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  NRT1.9
56 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  ATDTX1; DTX1; TX1
57 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  AT2G26900
58 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  ADS2; DS2
59 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  AT1G66760
60 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  ATFKBP42; FKBP42; TWD1; UCU2
61 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  ATDAD1
62 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  AT1G21940
63 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  AT3G11810
64 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  AT5G19570
65 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  AT2G29180
66 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  AT1G15900
67 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  AT2G33250
68 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  AT3G02420
69 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  AT3G62400
70 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  AT4G15620
71 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  AT2G36330
72 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  TET6
73 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  AT4G04750
74 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  ATNPSN13; NPSN13
75 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  AT4G30660
76 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  AtVHP2;1; AVP2; AVPL1; VHP2;1; VP2
77 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  AT1G16560
78 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  AT3G15710
79 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  AT1G09380
80 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  AT4G08300
81 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  AT2G23093
82 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  AT2G38330
83 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  AT5G49130
84 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  AT4G14420
85 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  AT4G28330
86 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  AT1G30080
87 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  AT4G12950
88 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  AT5G10840
89 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  AT2G01970
90 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  AT2G36430
91 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  AT1G12500
92 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  AtENODL9; ENODL9
93 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  AtENODL15; ENODL15
94 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  DER1
95 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  DAD2
96 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  PDLP8
97 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  AT3G26110
98 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  interacts with  --  AGP16; ATAGP16
99 SBH1  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2  --  is the target gene of  --  ath-miR780.1
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact