Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node SLY1
Type: Protein GRN ID: np06029 Name: SLY1
Annotation: SLY1 | F-box family protein
Gene Locus: AT4G24210
References:
  • Fu X, Richards DE, Fleck B, Xie D, Burton N, Harberd NP. The Arabidopsis mutant sleepy1gar2-1 protein promotes plant growth by increasing the affinity of the SCFSLY1 E3 ubiquitin ligase for DELLA protein substrates. Plant Cell. 2004 Jun;16(6):1406-18. Epub 2004 May 25. PubMed PMID: 15161962; PubMed Central PMCID: PMC490035.
  • Strader LC, Ritchie S, Soule JD, McGinnis KM, Steber CM. Recessive-interfering mutations in the gibberellin signaling gene SLEEPY1 are rescued by overexpression of its homologue, SNEEZY. Proc Natl Acad Sci U S A. 2004 Aug 24;101(34):12771-6. Epub 2004 Aug 12. PubMed PMID: 15308775; PubMed Central PMCID: PMC515128.
 
Pathways: Gibberellins 
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 254160_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13
3 SLY1  --  interacts with  --  RGL
4 SLY1  --  interacts with  --  RGA1
5 SLY1  --  is a member of  --  SLY1 family98, coding gene
6 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AtPP2-A13; PP2-A13
7 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT1G67340
8 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT4G38940
9 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT1G76920
10 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT1G55000
11 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT3G04660
12 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  HS; HWS
13 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AtTLP3; TLP3
14 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT3G03360
15 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT1G30790
16 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT5G63520
17 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT5G52880
18 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT5G51250
19 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT5G45360
20 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  EBF2
21 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  FBX2
22 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AtTLP11; TLP11
23 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT5G15710
24 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT5G03970
25 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT4G39290
26 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT4G39240
27 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT4G29370
28 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT4G19940
29 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT4G17200
30 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  FBW2
31 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT4G05460
32 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT4G02310
33 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT3G62430
34 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT3G57580
35 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT3G48880
36 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT3G46050
37 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT3G44130
38 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AFB2
39 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT3G26010
40 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT3G24580
41 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT3G21130
42 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT3G19560
43 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT3G18720
44 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT3G17540
45 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT3G16580
46 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT3G13830
47 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT3G13820
48 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT3G06240
49 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT2G44130
50 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT2G44030
51 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  EBF1
52 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AtTLP2; TLP2
53 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT2G17030
54 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT2G14710
55 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AtPP2-B1; PP2-B1
56 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT1G78100
57 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  ATSKP2;2; SKP2B
58 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AtTLP1; TLP1
59 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT1G76830
60 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT1G70590
61 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT1G67190
62 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT1G60570
63 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT1G53790
64 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT1G51550
65 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT1G47340
66 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AtTLP6; TLP6
67 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT1G30920
68 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT1G23780
69 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT1G23390
70 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT1G22220
71 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  ATFBP7; FBP7
72 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  SKP2A
73 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT1G13570
74 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT2G22030
75 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  EDL3
76 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  CPR30
77 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  ATCUL1
78 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  EID1
79 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT5G49610
80 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT4G39550
81 SLY1  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  ADO3; FKF1
82 SLY1  --  interacts with  --  RGL  --  interacts with  --  JAZ1
83 SLY1  --  interacts with  --  RGL  --  interacts with  --  HAP5C; NF-YC9
84 SLY1  --  interacts with  --  RGL  --  interacts with  --  ATHAP2B; HAP2B; NF-YA2; UNE8
85 SLY1  --  interacts with  --  RGL  --  interacts with  --  AT5G59980
86 SLY1  --  interacts with  --  RGL  --  interacts with  --  ATMYC2
87 SLY1  --  interacts with  --  RGL  --  interacts with  --  ENY; IDD1
88 SLY1  --  interacts with  --  RGL  --  interacts with  --  ATGID1A
89 SLY1  --  interacts with  --  RGL  --  interacts with  --  PIF3
90 SLY1  --  interacts with  --  RGL  --  is a member of  --  della family, transcription factor gene
91 SLY1  --  interacts with  --  RGL  --  is a member of  --  RGA1 family99, transcription factor gene
92 SLY1  --  interacts with  --  RGL  --  is a member of  --  polyubiquitinated della family, transcription factor gene
93 SLY1  --  interacts with  --  RGA1  --  regulates the expression of   --  LGO; SMR1
94 SLY1  --  interacts with  --  RGA1  --  is regulated by  --  JAI3
95 SLY1  --  interacts with  --  RGA1  --  is regulated by  --  pil5
96 SLY1  --  interacts with  --  RGA1  --  interacts with  --  PDF2
97 SLY1  --  interacts with  --  RGA1  --  interacts with  --  ATML1
98 SLY1  --  interacts with  --  RGA1  --  interacts with  --  NF-YB2
99 SLY1  --  interacts with  --  RGA1  --  interacts with  --  ATHAP2A; EMB2220; HAP2A; NF-YA1
100 SLY1  --  interacts with  --  RGA1  --  interacts with  --  NF-YC3
101 SLY1  --  interacts with  --  RGA1  --  interacts with  --  JKD
102 SLY1  --  interacts with  --  RGA1  --  interacts with  --  AT3G45260
103 SLY1  --  interacts with  --  RGA1  --  interacts with  --  AtIDD5; IDD5
104 SLY1  --  interacts with  --  RGA1  --  interacts with  --  AtIDD4; IDD4
105 SLY1  --  interacts with  --  RGA1  --  interacts with  --  MGP
106 SLY1  --  interacts with  --  RGA1  --  interacts with  --  ARF8
107 SLY1  --  interacts with  --  RGA1  --  interacts with  --  ARF7
108 SLY1  --  interacts with  --  RGA1  --  interacts with  --  ARF6
109 SLY1  --  interacts with  --  RGA1  --  interacts with  --  AT1G35560
110 SLY1  --  interacts with  --  RGA1  --  interacts with  --  AT1G72010
111 SLY1  --  interacts with  --  RGA1  --  interacts with  --  AT-TCP20; ATTCP20; PCF1; TCP20
112 SLY1  --  interacts with  --  RGA1  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15
113 SLY1  --  interacts with  --  RGA1  --  interacts with  --  AT2G45680
114 SLY1  --  interacts with  --  RGA1  --  interacts with  --  TCP8
115 SLY1  --  interacts with  --  RGA1  --  interacts with  --  GL3; GL3; MYC6.2
116 SLY1  --  interacts with  --  RGA1  --  interacts with  --  ATMYC-2; EGL1; EGL3
117 SLY1  --  interacts with  --  RGA1  --  interacts with  --  ATGL1; ATMYB0; GL1; MYB0
118 SLY1  --  interacts with  --  RGA1  --  interacts with  --  TMKL1
119 SLY1  --  interacts with  --  RGA1  --  interacts with  --  JAZ9
120 SLY1  --  interacts with  --  RGA1  --  interacts with  --  ATEBP; EBP; ERF72; RAP2.3
121 SLY1  --  interacts with  --  RGA1  --  interacts with  --  AT5G62260
122 SLY1  --  interacts with  --  RGA1  --  interacts with  --  AT5G12190
123 SLY1  --  interacts with  --  RGA1  --  interacts with  --  ABC1; ABCI8; ATABC1; ATNAP1; LAF6
124 SLY1  --  interacts with  --  RGA1  --  interacts with  --  AT3G13740
125 SLY1  --  interacts with  --  RGA1  --  interacts with  --  NDF4
126 SLY1  --  interacts with  --  RGA1  --  interacts with  --  FRL1
127 SLY1  --  interacts with  --  RGA1  --  interacts with  --  PAD1
128 SLY1  --  interacts with  --  RGA1  --  interacts with  --  PIF6; PIL2
129 SLY1  --  interacts with  --  RGA1  --  interacts with  --  spatula
130 SLY1  --  interacts with  --  RGA1  --  interacts with  --  PIF4
131 SLY1  --  interacts with  --  RGA1  --  interacts with  --  ATHAM2; HAM2; LOM2
132 SLY1  --  interacts with  --  RGA1  --  interacts with  --  ATHAM1; HAM1; LOM1
133 SLY1  --  interacts with  --  RGA1  --  interacts with  --  BBX24; STO
134 SLY1  --  interacts with  --  RGA1  --  interacts with  --  ATSAE2; EMB2764; SAE2
135 SLY1  --  interacts with  --  RGA1  --  interacts with  --  AT-SAE1-1; ATSAE1A; SAE1A
136 SLY1  --  interacts with  --  RGA1  --  interacts with  --  OTS1; ULP1D
137 SLY1  --  interacts with  --  RGA1  --  interacts with  --  ATMPK18; MPK18
138 SLY1  --  interacts with  --  RGA1  --  interacts with  --  SCL3
139 SLY1  --  interacts with  --  RGA1  --  interacts with  --  ALC
140 SLY1  --  interacts with  --  RGA1  --  interacts with  --  ATGID1C
141 SLY1  --  interacts with  --  RGA1  --  interacts with  --  ATGID1B
142 SLY1  --  interacts with  --  RGA1  --  is a member of  --  RGA1 family100, transcription factor gene
143 SLY1  --  is a member of  --  SLY1 family98, coding gene  --  has family member  --  SLY2
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact