Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node BIM3
Type: Protein GRN ID: np01057 Name: BIM3
Annotation: BIM3 | BES1-interacting Myc-like protein 3
Gene Locus: AT5G38860
Transcription factor /
transcriptional regulator:		 transcription factor family bHLH
References:
  • Yin Y, Vafeados D, Tao Y, Yoshida S, Asami T, Chory J. A new class of transcription factors mediates brassinosteroid-regulated gene expression in Arabidopsis. Cell. 2005 Jan 28;120(2):249-59. PubMed PMID: 15680330.
 
Pathways: Brassinosteroids;  Gibberellins;  Jasmonates 
Gene Expression (Affy ATH1 probeset):
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 BIM3  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8
3 BIM3  --  interacts with  --  BES1
4 BIM3  --  is regulated by  --  JAZ10
5 BIM3  --  is regulated by  --  JAZ8
6 BIM3  --  is regulated by  --  JAZ1
7 BIM3  --  is a member of  --  BIM1 family16, transcription factor gene
8 BIM3  --  is a member of  --  DRN family10, transcription factor gene
9 BIM3  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  interacts with  --  ATPUB14; PUB14
10 BIM3  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  CDPK6
11 BIM3  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  AT3G20530
12 BIM3  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  AtITPK4; ITPK4
13 BIM3  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  CST; CX32
14 BIM3  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  AtMYB110; MYB110
15 BIM3  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  ASK18; SK18
16 BIM3  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  AGL50
17 BIM3  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  CRCK2
18 BIM3  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  BZIP45
19 BIM3  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  AT2G31390
20 BIM3  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  AtbZIP67; DPBF2
21 BIM3  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  IMK2
22 BIM3  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  AGL15
23 BIM3  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  RBK1
24 BIM3  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  AT1G35460
25 BIM3  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  ATMPK18; MPK18
26 BIM3  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  AGL75
27 BIM3  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  AT2G38250
28 BIM3  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  PFK3
29 BIM3  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  ATMYB123; ATTT2; MYB123; TT2
30 BIM3  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  AtTCP11; TCP11
31 BIM3  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  AtMYB42; MYB42
32 BIM3  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  KAN; KAN1
33 BIM3  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  AT2G26695
34 BIM3  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  GATA24; TIFY2B; ZML1; ZML1
35 BIM3  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  AT2G45910
36 BIM3  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  AGL11; STK
37 BIM3  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  AT1G71450
38 BIM3  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  ANAC092; ATNAC2; ATNAC6; NAC2; NAC6; ORE1
39 BIM3  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  TRY
40 BIM3  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  W-BOX
41 BIM3  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  AGL49
42 BIM3  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  AT5G47390
43 BIM3  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  AT5G47660
44 BIM3  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  AT1G23220
45 BIM3  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  AtMYB103; MYB103
46 BIM3  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  modify  --  AT2G34450
47 BIM3  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8  --  is modified by  --  ATMKK3
48 BIM3  --  interacts with  --  BES1  --  regulates the expression of   --  ATGLK2; GLK2; GPRI2
49 BIM3  --  interacts with  --  BES1  --  regulates the expression of   --  ATGLK1; GLK1; GPRI1
50 BIM3  --  interacts with  --  BES1  --  regulates the expression of   --  BPG2
51 BIM3  --  interacts with  --  BES1  --  regulates the expression of   --  ATMYB30
52 BIM3  --  interacts with  --  BES1  --  regulates the expression of   --  ARF5
53 BIM3  --  interacts with  --  BES1  --  regulates the expression of   --  GL2
54 BIM3  --  interacts with  --  BES1  --  regulates the expression of   --  ATMYB66; MYB66; WER; WER1
55 BIM3  --  interacts with  --  BES1  --  regulates the expression of   --  CYC2; CYCB1;3
56 BIM3  --  interacts with  --  BES1  --  regulates the expression of   --  CYCB1;4
57 BIM3  --  interacts with  --  BES1  --  regulates the expression of   --  CYC3; CYCB1;5
58 BIM3  --  interacts with  --  BES1  --  regulates the expression of   --  CYC1; CYCB1; CYCB1;1
59 BIM3  --  interacts with  --  BES1  --  regulates the expression of   --  CYCD3; CYCD3;1
60 BIM3  --  interacts with  --  BES1  --  regulates the expression of   --  PIF7
61 BIM3  --  interacts with  --  BES1  --  regulates the expression of   --  PIF6; PIL2
62 BIM3  --  interacts with  --  BES1  --  regulates the expression of   --  PIF5; PIL6
63 BIM3  --  interacts with  --  BES1  --  regulates the expression of   --  PIF4
64 BIM3  --  interacts with  --  BES1  --  regulates the expression of   --  PIF3
65 BIM3  --  interacts with  --  BES1  --  regulates the expression of   --  PIFI
66 BIM3  --  interacts with  --  BES1  --  regulates the expression of   --  della family, transcription factor gene
67 BIM3  --  interacts with  --  BES1  --  regulates the expression of   --  ARF1 family35, transcription factor gene
68 BIM3  --  interacts with  --  BES1  --  regulates the expression of   --  BIM1
69 BIM3  --  interacts with  --  BES1  --  regulates the expression of   --  AT3G48430
70 BIM3  --  interacts with  --  BES1  --  regulates the expression of   --  AT5G04240
71 BIM3  --  interacts with  --  BES1  --  regulates the expression of   --  HERK1/THE1 family13, coding gene
72 BIM3  --  interacts with  --  BES1  --  regulates the expression of   --  ATSAUR15; SAUR-AC1; SAUR15; SAUR_AC1
73 BIM3  --  interacts with  --  BES1  --  regulates the expression of   --  FAR2; MS2
74 BIM3  --  interacts with  --  BES1  --  interacts with  --  AtHsp90.2; ERD8; HSP81-2; HSP90.2
75 BIM3  --  interacts with  --  BES1  --  interacts with  --  HAT1
76 BIM3  --  interacts with  --  BES1  --  interacts with  --  AtIWS1
77 BIM3  --  interacts with  --  BES1  --  interacts with  --  ASHH2; CCR1; EFS; LAZ2; SDG8
78 BIM3  --  interacts with  --  BES1  --  interacts with  --  MAX2; ORE9; PPS
79 BIM3  --  interacts with  --  BES1  --  interacts with  --  ATB' BETA
80 BIM3  --  interacts with  --  BES1  --  interacts with  --  ATB' ALPHA
81 BIM3  --  interacts with  --  BES1  --  interacts with  --  ATMYBL2; MYBL2
82 BIM3  --  interacts with  --  BES1  --  interacts with  --  BIM2
83 BIM3  --  interacts with  --  BES1  --  is a member of  --  BZR1 family6, transcription factor gene
84 BIM3  --  interacts with  --  BES1  --  is a member of  --  BES1 family7, transcription factor gene
85 BIM3  --  interacts with  --  BES1  --  is a member of  --  bri1 complex7
86 BIM3  --  interacts with  --  BES1  --  is modified by  --  ASKTHETA; ATSK32; SK32
87 BIM3  --  interacts with  --  BES1  --  is modified by  --  ASKdZeta
88 BIM3  --  interacts with  --  BES1  --  is modified by  --  ATGSK1; ATSK2-3; ATSK22; BIL2; GSK1; SK22
89 BIM3  --  is regulated by  --  JAZ10  --  regulates the expression of   --  AtMYB24; MYB24
90 BIM3  --  is regulated by  --  JAZ10  --  regulates the expression of   --  ATMYB21; ATMYB3; MYB21
91 BIM3  --  is regulated by  --  JAZ10  --  regulates the expression of   --  ATGL1; ATMYB0; GL1; MYB0
92 BIM3  --  is regulated by  --  JAZ10  --  regulates the expression of   --  BHLH42; TT8
93 BIM3  --  is regulated by  --  JAZ10  --  regulates the expression of   --  GL3; GL3; MYC6.2
94 BIM3  --  is regulated by  --  JAZ10  --  regulates the expression of   --  ATMYC-2; EGL1; EGL3
95 BIM3  --  is regulated by  --  JAZ10  --  interacts with  --  NINJA
96 BIM3  --  is regulated by  --  JAZ10  --  interacts with  --  AT4G00870
97 BIM3  --  is regulated by  --  JAZ10  --  interacts with  --  AT4G16430
98 BIM3  --  is regulated by  --  JAZ10  --  interacts with  --  AIB; ATAIB
99 BIM3  --  is regulated by  --  JAZ10  --  interacts with  --  AT1G01260
100 BIM3  --  is regulated by  --  JAZ10  --  interacts with  --  MYC4
101 BIM3  --  is regulated by  --  JAZ10  --  interacts with  --  MYC3
102 BIM3  --  is regulated by  --  JAZ10  --  interacts with  --  ATMYC2
103 BIM3  --  is regulated by  --  JAZ10  --  interacts with  --  COI1
104 BIM3  --  is regulated by  --  JAZ10  --  is a member of  --  JAI3 family107, transcription factor gene
105 BIM3  --  is regulated by  --  JAZ8  --  regulates the expression of   --  ATMYB75; MYB75; PAP1; SIAA1
106 BIM3  --  is regulated by  --  JAZ8  --  interacts with  --  ATWRKY57; WRKY57
107 BIM3  --  is regulated by  --  JAZ1  --  regulates the expression of   --  RGL3
108 BIM3  --  is regulated by  --  JAZ1  --  regulates the expression of   --  RGL2
109 BIM3  --  is regulated by  --  JAZ1  --  regulates the expression of   --  RGL
110 BIM3  --  is regulated by  --  JAZ1  --  regulates the expression of   --  EIL1
111 BIM3  --  is regulated by  --  JAZ1  --  interacts with  --  JAZ9
112 BIM3  --  is regulated by  --  JAZ1  --  interacts with  --  JAZ4
113 BIM3  --  is regulated by  --  JAZ1  --  interacts with  --  RGA1
114 BIM3  --  is regulated by  --  JAZ1  --  interacts with  --  ICE2; SCRM2
115 BIM3  --  is regulated by  --  JAZ1  --  interacts with  --  ATICE1; ICE1; SCRM
116 BIM3  --  is regulated by  --  JAZ1  --  interacts with  --  AT3G14080
117 BIM3  --  is regulated by  --  JAZ1  --  interacts with  --  LSU2
118 BIM3  --  is regulated by  --  JAZ1  --  interacts with  --  AT3G11830
119 BIM3  --  is regulated by  --  JAZ1  --  interacts with  --  AT5G14260
120 BIM3  --  is regulated by  --  JAZ1  --  interacts with  --  LSU1
121 BIM3  --  is regulated by  --  JAZ1  --  interacts with  --  EIN3
122 BIM3  --  is regulated by  --  JAZ1  --  is a member of  --  jaz complexes
123 BIM3  --  is a member of  --  DRN family10, transcription factor gene  --  has family member  --  DRN-LIKE
124 BIM3  --  is a member of  --  DRN family10, transcription factor gene  --  has family member  --  DRN
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact