Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node ATSERK1
Type: Protein GRN ID: np01017 Name: ATSERK1
Annotation: SERK1, ATSERK1 | somatic embryogenesis receptor-like kinase 1 [TCDB:2.A.7.19] [EC:2.7.10.1] [EC:2.7.11.1]
Gene Locus: AT1G71830
References:
  • Karlova R, Boeren S, Russinova E, Aker J, Vervoort J, de Vries S. The Arabidopsis SOMATIC EMBRYOGENESIS RECEPTOR-LIKE KINASE1 protein complex includes BRASSINOSTEROID-INSENSITIVE1. Plant Cell. 2006 Mar;18(3):626-38. Epub 2006 Feb 10. PubMed PMID: 16473966; PubMed Central PMCID: PMC1383638.
 
Pathways: Brassinosteroids 
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 261521_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 ATSERK1  --  interacts with  --  CDC48A
3 ATSERK1  --  interacts with  --  KAPP; RAG1
4 ATSERK1  --  interacts with  --  BRI1/BIN1
5 ATSERK1  --  interacts with  --  BAK1
6 ATSERK1  --  interacts with  --  ATSERK2; SERK2
7 ATSERK1  --  interacts with  --  AT2G41820
8 ATSERK1  --  interacts with  --  ABF1
9 ATSERK1  --  interacts with  --  PDLP6
10 ATSERK1  --  interacts with  --  ARAC6; ATRAC6; ATROP5; RAC2; RAC6; ROP5
11 ATSERK1  --  transport  --  5-FU
12 ATSERK1  --  transport  --  Allantoin
13 ATSERK1  --  transport  --  Xanthine
14 ATSERK1  --  transport  --  Urate
15 ATSERK1  --  transport  --  Uracil
16 ATSERK1  --  is a member of  --  BAK1 family4, coding gene
17 ATSERK1  --  interacts with  --  CDC48A  --  interacts with  --  AtMC9; AtMCP2f; MC9; MCP2f
18 ATSERK1  --  interacts with  --  CDC48A  --  interacts with  --  AT1G14570
19 ATSERK1  --  interacts with  --  CDC48A  --  interacts with  --  ATSED5; ATSYP31; SED5; SYP31
20 ATSERK1  --  interacts with  --  CDC48A  --  interacts with  --  PUX5
21 ATSERK1  --  interacts with  --  CDC48A  --  interacts with  --  PUX1
22 ATSERK1  --  interacts with  --  KAPP; RAG1  --  interacts with  --  CRK6
23 ATSERK1  --  interacts with  --  KAPP; RAG1  --  interacts with  --  ATCLV1; CLV1; FAS3; FLO5
24 ATSERK1  --  interacts with  --  KAPP; RAG1  --  interacts with  --  AT5G15240
25 ATSERK1  --  interacts with  --  KAPP; RAG1  --  interacts with  --  CRN; SOL2
26 ATSERK1  --  interacts with  --  KAPP; RAG1  --  interacts with  --  FLS2
27 ATSERK1  --  interacts with  --  BRI1/BIN1  --  interacts with  --  ATSYP22; ATVAM3; SGR3; SYP22; VAM3
28 ATSERK1  --  interacts with  --  BRI1/BIN1  --  interacts with  --  ATVAMP727; VAMP727; VAMP727
29 ATSERK1  --  interacts with  --  BRI1/BIN1  --  interacts with  --  BIK1
30 ATSERK1  --  interacts with  --  BRI1/BIN1  --  interacts with  --  AT1G50990
31 ATSERK1  --  interacts with  --  BRI1/BIN1  --  interacts with  --  AT5G41260
32 ATSERK1  --  interacts with  --  BRI1/BIN1  --  interacts with  --  AT5G59010
33 ATSERK1  --  interacts with  --  BRI1/BIN1  --  interacts with  --  AT3G54030
34 ATSERK1  --  interacts with  --  BRI1/BIN1  --  interacts with  --  bsk3
35 ATSERK1  --  interacts with  --  BRI1/BIN1  --  interacts with  --  bsk1
36 ATSERK1  --  interacts with  --  BRI1/BIN1  --  interacts with  --  TTL
37 ATSERK1  --  interacts with  --  BRI1/BIN1  --  interacts with  --  AT1G18470
38 ATSERK1  --  interacts with  --  BRI1/BIN1  --  interacts with  --  BKI1
39 ATSERK1  --  interacts with  --  BRI1/BIN1  --  modify  --  AT5G42470
40 ATSERK1  --  interacts with  --  BRI1/BIN1  --  modify  --  ACAM-6; CAM6
41 ATSERK1  --  interacts with  --  BRI1/BIN1  --  modify  --  bsk2
42 ATSERK1  --  interacts with  --  BRI1/BIN1  --  modify  --  AT5G02800
43 ATSERK1  --  interacts with  --  BRI1/BIN1  --  modify  --  CDG1
44 ATSERK1  --  interacts with  --  BRI1/BIN1  --  is modified by  --  BIR1
45 ATSERK1  --  interacts with  --  BRI1/BIN1  --  transport  --  Phospholipid
46 ATSERK1  --  interacts with  --  BRI1/BIN1  --  is a member of  --  BRI1+BIN1 family3, coding gene
47 ATSERK1  --  interacts with  --  BAK1  --  interacts with  --  BSL2
48 ATSERK1  --  interacts with  --  BAK1  --  interacts with  --  AT3G28450
49 ATSERK1  --  interacts with  --  BAK1  --  interacts with  --  AtPUB12; PUB12
50 ATSERK1  --  interacts with  --  BAK1  --  interacts with  --  ATPUB13; PUB13
51 ATSERK1  --  interacts with  --  BAK1  --  interacts with  --  BON; BON1; CPN1
52 ATSERK1  --  interacts with  --  BAK1  --  interacts with  --  AtPEPR2; PEPR2
53 ATSERK1  --  interacts with  --  BAK1  --  interacts with  --  ATPEPR1; PEPR1
54 ATSERK1  --  interacts with  --  BAK1  --  interacts with  --  ATRBOH D
55 ATSERK1  --  interacts with  --  BAK1  --  interacts with  --  IOS1
56 ATSERK1  --  interacts with  --  BAK1  --  interacts with  --  EFR
57 ATSERK1  --  interacts with  --  BAK1  --  interacts with  --  AtMAPR5; ATMP1; MSBP1
58 ATSERK1  --  interacts with  --  BAK1  --  interacts with  --  BRL3
59 ATSERK1  --  interacts with  --  BAK1  --  modify  --  ATFLS2; FLS2
60 ATSERK1  --  interacts with  --  BAK1  --  is the target gene of  --  ath-miR866-5p
61 ATSERK1  --  interacts with  --  ATSERK2; SERK2  --  interacts with  --  AT5G49760
62 ATSERK1  --  interacts with  --  ATSERK2; SERK2  --  interacts with  --  AT5G55330
63 ATSERK1  --  interacts with  --  ATSERK2; SERK2  --  interacts with  --  ATNRAMP2; NRAMP2
64 ATSERK1  --  interacts with  --  ATSERK2; SERK2  --  interacts with  --  AT4G20450
65 ATSERK1  --  interacts with  --  ATSERK2; SERK2  --  interacts with  --  ATCHX19; CHX19
66 ATSERK1  --  interacts with  --  ATSERK2; SERK2  --  transport  --  Molybdate
67 ATSERK1  --  interacts with  --  ATSERK2; SERK2  --  transport  --  HO-
68 ATSERK1  --  interacts with  --  ATSERK2; SERK2  --  transport  --  Bromide
69 ATSERK1  --  interacts with  --  ATSERK2; SERK2  --  transport  --  Iodide
70 ATSERK1  --  interacts with  --  ATSERK2; SERK2  --  transport  --  Cl-
71 ATSERK1  --  interacts with  --  ATSERK2; SERK2  --  transport  --  HCO3-
72 ATSERK1  --  interacts with  --  ATSERK2; SERK2  --  transport  --  Sulfate
73 ATSERK1  --  interacts with  --  AT2G41820  --  interacts with  --  ARFA1D; ATARFA1D
74 ATSERK1  --  interacts with  --  AT2G41820  --  interacts with  --  AT1G27290
75 ATSERK1  --  interacts with  --  AT2G41820  --  interacts with  --  AT4G27610
76 ATSERK1  --  interacts with  --  AT2G41820  --  interacts with  --  AT5G35460
77 ATSERK1  --  interacts with  --  AT2G41820  --  interacts with  --  AT2G32380
78 ATSERK1  --  interacts with  --  AT2G41820  --  interacts with  --  SRF1
79 ATSERK1  --  interacts with  --  AT2G41820  --  interacts with  --  AtRABH1c; RABH1c
80 ATSERK1  --  interacts with  --  AT2G41820  --  interacts with  --  AT3G26370
81 ATSERK1  --  interacts with  --  AT2G41820  --  interacts with  --  ATMAPR3; ATMP2; MAPR3; MSBP2
82 ATSERK1  --  interacts with  --  AT2G41820  --  interacts with  --  AtMAPR2; MAPR2
83 ATSERK1  --  interacts with  --  AT2G41820  --  interacts with  --  ATDHAR1; DHAR1; DHAR5
84 ATSERK1  --  interacts with  --  AT2G41820  --  interacts with  --  ATGSTU19; GST8; GSTU19
85 ATSERK1  --  interacts with  --  AT2G41820  --  interacts with  --  ATHS1; HS1
86 ATSERK1  --  interacts with  --  AT2G41820  --  interacts with  --  AT4G12950
87 ATSERK1  --  interacts with  --  AT2G41820  --  interacts with  --  AT5G10290
88 ATSERK1  --  interacts with  --  AT2G41820  --  interacts with  --  AT5G63930
89 ATSERK1  --  interacts with  --  AT2G41820  --  interacts with  --  AT5G25930
90 ATSERK1  --  interacts with  --  AT2G41820  --  interacts with  --  ZF14; ZRZ
91 ATSERK1  --  interacts with  --  AT2G41820  --  interacts with  --  AT3G06170
92 ATSERK1  --  interacts with  --  AT2G41820  --  interacts with  --  AT2G28990
93 ATSERK1  --  interacts with  --  AT2G41820  --  interacts with  --  AT4G28650
94 ATSERK1  --  interacts with  --  AT2G41820  --  interacts with  --  AT2G24230
95 ATSERK1  --  interacts with  --  AT2G41820  --  interacts with  --  AT3G02880
96 ATSERK1  --  interacts with  --  AT2G41820  --  interacts with  --  ATPLC2; PLC2
97 ATSERK1  --  interacts with  --  AT2G41820  --  interacts with  --  AT3G42880
98 ATSERK1  --  interacts with  --  AT2G41820  --  interacts with  --  AT1G07550
99 ATSERK1  --  interacts with  --  AT2G41820  --  interacts with  --  AT2G16250
100 ATSERK1  --  interacts with  --  AT2G41820  --  interacts with  --  AT3G03770
101 ATSERK1  --  interacts with  --  AT2G41820  --  interacts with  --  AT4G23740
102 ATSERK1  --  interacts with  --  AT2G41820  --  interacts with  --  AT4G36180
103 ATSERK1  --  interacts with  --  AT2G41820  --  interacts with  --  AT5G62710
104 ATSERK1  --  interacts with  --  AT2G41820  --  interacts with  --  FRK1
105 ATSERK1  --  interacts with  --  ABF1  --  interacts with  --  ABF3
106 ATSERK1  --  interacts with  --  ABF1  --  interacts with  --  ABI5
107 ATSERK1  --  interacts with  --  ABF1  --  interacts with  --  AHG3/pp2ca
108 ATSERK1  --  interacts with  --  ABF1  --  interacts with  --  AHG1
109 ATSERK1  --  interacts with  --  ABF1  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11
110 ATSERK1  --  interacts with  --  ABF1  --  interacts with  --  SNRK2-3
111 ATSERK1  --  interacts with  --  ABF1  --  interacts with  --  SNRK2-2
112 ATSERK1  --  interacts with  --  ABF1  --  interacts with  --  ATCPK32
113 ATSERK1  --  interacts with  --  ABF1  --  interacts with  --  AtbZIP67; DPBF2
114 ATSERK1  --  interacts with  --  ABF1  --  interacts with  --  ABF4/AREB2
115 ATSERK1  --  interacts with  --  ABF1  --  interacts with  --  ABF2/AREB1
116 ATSERK1  --  interacts with  --  ABF1  --  interacts with  --  KEG
117 ATSERK1  --  interacts with  --  ABF1  --  interacts with  --  ATCDPK9; ATCPK12; CDPK9; CPK12
118 ATSERK1  --  interacts with  --  ABF1  --  is a member of  --  ABF1 family47, transcription factor gene
119 ATSERK1  --  interacts with  --  ABF1  --  is modified by  --  CPK4
120 ATSERK1  --  interacts with  --  PDLP6  --  interacts with  --  AT4G14480
121 ATSERK1  --  interacts with  --  PDLP6  --  interacts with  --  AT1G72180
122 ATSERK1  --  interacts with  --  PDLP6  --  interacts with  --  AT1G71020
123 ATSERK1  --  interacts with  --  PDLP6  --  interacts with  --  ATSUC9; SUC9
124 ATSERK1  --  interacts with  --  PDLP6  --  interacts with  --  AT3G08930
125 ATSERK1  --  interacts with  --  ARAC6; ATRAC6; ATROP5; RAC2; RAC6; ROP5  --  interacts with  --  ATMLO2; MLO2; PMR2
126 ATSERK1  --  interacts with  --  ARAC6; ATRAC6; ATROP5; RAC2; RAC6; ROP5  --  interacts with  --  AT2G28960
127 ATSERK1  --  interacts with  --  ARAC6; ATRAC6; ATROP5; RAC2; RAC6; ROP5  --  interacts with  --  GCR1
128 ATSERK1  --  interacts with  --  ARAC6; ATRAC6; ATROP5; RAC2; RAC6; ROP5  --  interacts with  --  HVA22J
129 ATSERK1  --  interacts with  --  ARAC6; ATRAC6; ATROP5; RAC2; RAC6; ROP5  --  interacts with  --  AT3G63380
130 ATSERK1  --  interacts with  --  ARAC6; ATRAC6; ATROP5; RAC2; RAC6; ROP5  --  interacts with  --  HAB1
131 ATSERK1  --  interacts with  --  ARAC6; ATRAC6; ATROP5; RAC2; RAC6; ROP5  --  interacts with  --  AT4G31250
132 ATSERK1  --  interacts with  --  ARAC6; ATRAC6; ATROP5; RAC2; RAC6; ROP5  --  interacts with  --  AT4G37250
133 ATSERK1  --  interacts with  --  ARAC6; ATRAC6; ATROP5; RAC2; RAC6; ROP5  --  interacts with  --  AT4G30520
134 ATSERK1  --  interacts with  --  ARAC6; ATRAC6; ATROP5; RAC2; RAC6; ROP5  --  interacts with  --  CYP83A1; REF2
135 ATSERK1  --  interacts with  --  ARAC6; ATRAC6; ATROP5; RAC2; RAC6; ROP5  --  interacts with  --  SRF2
136 ATSERK1  --  interacts with  --  ARAC6; ATRAC6; ATROP5; RAC2; RAC6; ROP5  --  interacts with  --  AT1G67510
137 ATSERK1  --  interacts with  --  ARAC6; ATRAC6; ATROP5; RAC2; RAC6; ROP5  --  interacts with  --  AT4G34220
138 ATSERK1  --  interacts with  --  ARAC6; ATRAC6; ATROP5; RAC2; RAC6; ROP5  --  interacts with  --  AT5G51560
139 ATSERK1  --  interacts with  --  ARAC6; ATRAC6; ATROP5; RAC2; RAC6; ROP5  --  interacts with  --  ATMKK10; MKK10
140 ATSERK1  --  interacts with  --  ARAC6; ATRAC6; ATROP5; RAC2; RAC6; ROP5  --  interacts with  --  AT5G43020
141 ATSERK1  --  interacts with  --  ARAC6; ATRAC6; ATROP5; RAC2; RAC6; ROP5  --  interacts with  --  CDCP2; LEJ2
142 ATSERK1  --  interacts with  --  ARAC6; ATRAC6; ATROP5; RAC2; RAC6; ROP5  --  interacts with  --  AT3G21690
143 ATSERK1  --  transport  --  5-FU  --  is transported by  --  AT1G76800
144 ATSERK1  --  transport  --  5-FU  --  is transported by  --  AT1G74250
145 ATSERK1  --  transport  --  5-FU  --  is transported by  --  GR-RBP5
146 ATSERK1  --  transport  --  5-FU  --  is transported by  --  AT1G68070
147 ATSERK1  --  transport  --  5-FU  --  is transported by  --  AT1G67760
148 ATSERK1  --  transport  --  5-FU  --  is transported by  --  ALE; ALE1
149 ATSERK1  --  transport  --  5-FU  --  is transported by  --  CPN60B; LEN1
150 ATSERK1  --  transport  --  5-FU  --  is transported by  --  PEX3; PEX3-2
151 ATSERK1  --  transport  --  5-FU  --  is transported by  --  AT1G20540
152 ATSERK1  --  transport  --  5-FU  --  is transported by  --  OPCL1
153 ATSERK1  --  transport  --  5-FU  --  is transported by  --  AT1G20500
154 ATSERK1  --  transport  --  5-FU  --  is transported by  --  AT1G06840
155 ATSERK1  --  transport  --  Allantoin  --  is transported by  --  AT1G60900
156 ATSERK1  --  transport  --  Xanthine  --  is transported by  --  ALDH5F1; ENF1; SSADH; SSADH1
157 ATSERK1  --  transport  --  Xanthine  --  is transported by  --  AT1G61740
158 ATSERK1  --  transport  --  Xanthine  --  is transported by  --  AT1G61550
159 ATSERK1  --  transport  --  Xanthine  --  is transported by  --  LHCA3
160 ATSERK1  --  transport  --  Xanthine  --  is transported by  --  AT1G21680
161 ATSERK1  --  transport  --  Xanthine  --  is transported by  --  AT1G21670
162 ATSERK1  --  transport  --  Xanthine  --  is transported by  --  AT1G14010
163 ATSERK1  --  transport  --  Xanthine  --  is transported by  --  KAB1; KV-BETA1
164 ATSERK1  --  transport  --  Urate  --  has product (in catalytic reaction)  --  5-Hydroxyisourate
165 ATSERK1  --  transport  --  Urate  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATXDH2; XDH2
166 ATSERK1  --  transport  --  Urate  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATXDH1; XDH1
167 ATSERK1  --  transport  --  Uracil  --  is product (in catalytic reaction) of  --  NSH1; URH1
168 ATSERK1  --  transport  --  Uracil  --  is product (in catalytic reaction) of  --  Uridine
169 ATSERK1  --  transport  --  Uracil  --  is product (in catalytic reaction) of  --  PYRR; UPP
170 ATSERK1  --  transport  --  Uracil  --  is product (in catalytic reaction) of  --  UMP
171 ATSERK1  --  transport  --  Uracil  --  is product (in catalytic reaction) of  --  PYD1
172 ATSERK1  --  transport  --  Uracil  --  is product (in catalytic reaction) of  --  5,6-Dihydrouracil
173 ATSERK1  --  is a member of  --  BAK1 family4, coding gene  --  is a member of  --  BRI1/BIN1 complex4
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact