Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node EBF2
Type: Protein GRN ID: np05025 Name: EBF2
Annotation: EBF2 | EIN3-binding F box protein 2
Gene Locus: AT5G25350
References:
  • Shtibel R. Susceptibility-resistance pattern of Neisseria meningitidis isolated in the province of Ontario, Canada. Ann Microbiol (Paris). 1979 Jul;130B(1):3-11. PubMed PMID: 159654.
  • Guo H, Ecker JR. Plant responses to ethylene gas are mediated by SCF(EBF1/EBF2)-dependent proteolysis of EIN3 transcription factor. Cell. 2003 Dec 12;115(6):667-77. PubMed PMID: 14675532.
 
Pathways: Ethylene 
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 246935_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14
3 EBF2  --  interacts with  --  ASK13; SK13
4 EBF2  --  interacts with  --  ASK12; SK12
5 EBF2  --  interacts with  --  ATCUL1
6 EBF2  --  interacts with  --  EIL1
7 EBF2  --  interacts with  --  EIN3
8 EBF2  --  is a member of  --  Family84, coding gene
9 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  ADO1; FKL2; LKP1; ZTL
10 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  MEE11
11 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT3G26000
12 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT1G27340
13 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT1G76920
14 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  UFO
15 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AtPP2-A14; PP2-A14
16 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  HS; HWS
17 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  ADO2; LKP2
18 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT5G63520
19 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT5G52880
20 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT5G45360
21 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT5G42430
22 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  FBX2
23 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT5G15710
24 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT5G03970
25 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT4G19940
26 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT4G19930
27 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  FBW2
28 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT4G05460
29 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT3G57580
30 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT3G26010
31 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT3G24760
32 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT3G23880
33 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT3G21130
34 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT3G19560
35 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT3G18720
36 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT3G17540
37 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT3G16580
38 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT3G16210
39 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT3G13830
40 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT3G10430
41 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT3G08750
42 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT3G06240
43 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT3G04660
44 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT3G03360
45 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT2G43270
46 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  DOR
47 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  EBF1
48 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT2G17030
49 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT2G17020
50 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT2G16220
51 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT2G14710
52 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AtPP2-B1; PP2-B1
53 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT1G78100
54 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT1G76830
55 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT1G67190
56 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT1G60570
57 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT1G57790
58 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT1G53790
59 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT1G51550
60 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT1G51290
61 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT1G47340
62 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT1G31080
63 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT1G30920
64 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT1G30790
65 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT1G23780
66 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT1G23390
67 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  ATFBP7; FBP7
68 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  SKP2A
69 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT1G13570
70 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT1G09650
71 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT1G47730
72 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  EDL3
73 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  CPR30
74 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  EID1
75 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT5G49610
76 EBF2  --  interacts with  --  ASK14; SK14  --  interacts with  --  AT4G39550
77 EBF2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AtPP2-A13; PP2-A13
78 EBF2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT1G67340
79 EBF2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT4G38940
80 EBF2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT1G55000
81 EBF2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AtTLP3; TLP3
82 EBF2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT5G51250
83 EBF2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AtTLP11; TLP11
84 EBF2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT4G39290
85 EBF2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT4G39240
86 EBF2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT4G29370
87 EBF2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  SLY1
88 EBF2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT4G17200
89 EBF2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT4G02310
90 EBF2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT3G62430
91 EBF2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT3G48880
92 EBF2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT3G46050
93 EBF2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT3G44130
94 EBF2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AFB2
95 EBF2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT3G24580
96 EBF2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT3G13820
97 EBF2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT2G44130
98 EBF2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT2G44030
99 EBF2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AtTLP2; TLP2
100 EBF2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  ATSKP2;2; SKP2B
101 EBF2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AtTLP1; TLP1
102 EBF2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT1G70590
103 EBF2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AtTLP6; TLP6
104 EBF2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT1G22220
105 EBF2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT2G22030
106 EBF2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  ADO3; FKF1
107 EBF2  --  interacts with  --  ASK12; SK12  --  interacts with  --  COI1
108 EBF2  --  interacts with  --  ASK12; SK12  --  interacts with  --  AT5G67140
109 EBF2  --  interacts with  --  ASK12; SK12  --  interacts with  --  AT5G39250
110 EBF2  --  interacts with  --  ASK12; SK12  --  interacts with  --  AT5G26960
111 EBF2  --  interacts with  --  ASK12; SK12  --  interacts with  --  AT5G15620
112 EBF2  --  interacts with  --  ASK12; SK12  --  interacts with  --  AT3G59200
113 EBF2  --  interacts with  --  ASK12; SK12  --  interacts with  --  AT3G59150
114 EBF2  --  interacts with  --  ASK12; SK12  --  interacts with  --  FBL17
115 EBF2  --  interacts with  --  ASK12; SK12  --  interacts with  --  SKIP5; SKP5
116 EBF2  --  interacts with  --  ASK12; SK12  --  interacts with  --  AT3G52030
117 EBF2  --  interacts with  --  ASK12; SK12  --  interacts with  --  AT3G16740
118 EBF2  --  interacts with  --  ASK12; SK12  --  interacts with  --  AT2G41170
119 EBF2  --  interacts with  --  ASK12; SK12  --  interacts with  --  AtPP2-B7; PP2-B7
120 EBF2  --  interacts with  --  ASK12; SK12  --  interacts with  --  AMR1
121 EBF2  --  interacts with  --  ASK12; SK12  --  interacts with  --  AtPP2-A11; PP2-A11
122 EBF2  --  interacts with  --  ASK12; SK12  --  interacts with  --  AT1G23770
123 EBF2  --  interacts with  --  ASK12; SK12  --  interacts with  --  AT1G10780
124 EBF2  --  interacts with  --  ASK12; SK12  --  interacts with  --  AT4G02740
125 EBF2  --  interacts with  --  ASK12; SK12  --  interacts with  --  AtPP2-B10; PP2-B10
126 EBF2  --  interacts with  --  ATCUL1  --  interacts with  --  AT1G01640
127 EBF2  --  interacts with  --  ATCUL1  --  interacts with  --  ATRBX1
128 EBF2  --  interacts with  --  ATCUL1  --  interacts with  --  ATCAND1
129 EBF2  --  interacts with  --  ATCUL1  --  interacts with  --  ATCSN2; COP12; CSN2; FUS12
130 EBF2  --  interacts with  --  ATCUL1  --  interacts with  --  ATE2F2; ATE2FC; E2FC
131 EBF2  --  interacts with  --  ATCUL1  --  interacts with  --  AXR2
132 EBF2  --  interacts with  --  ATCUL1  --  interacts with  --  ASK1
133 EBF2  --  interacts with  --  ATCUL1  --  is a member of  --  COI1 complex26
134 EBF2  --  interacts with  --  ATCUL1  --  is a member of  --  COI1 complex25
135 EBF2  --  interacts with  --  ATCUL1  --  is a member of  --  np2055 complex12
136 EBF2  --  interacts with  --  EIL1  --  interacts with  --  MYC4
137 EBF2  --  interacts with  --  EIL1  --  interacts with  --  MYC3
138 EBF2  --  interacts with  --  EIL1  --  interacts with  --  ATMYC2
139 EBF2  --  interacts with  --  EIL1  --  interacts with  --  Family89, coding gene
140 EBF2  --  interacts with  --  EIL1  --  interacts with  --  ATBHLH029; ATBHLH29; ATFIT1; BHLH029; FIT1; FRU
141 EBF2  --  interacts with  --  EIL1  --  is a member of  --  Family83, transcription factor gene
142 EBF2  --  interacts with  --  EIL1  --  is regulated by  --  JAZ1
143 EBF2  --  interacts with  --  EIL1  --  is regulated by  --  JAI3 family107, transcription factor gene
144 EBF2  --  interacts with  --  EIN3  --  regulates the expression of   --  ATERF11
145 EBF2  --  interacts with  --  EIN3  --  regulates the expression of   --  ATERF13
146 EBF2  --  interacts with  --  EIN3  --  regulates the expression of   --  AT3G23220
147 EBF2  --  interacts with  --  EIN3  --  regulates the expression of   --  ATERF1
148 EBF2  --  interacts with  --  EIN3  --  is regulated by  --  CAMTA3; SR1
149 EBF2  --  interacts with  --  EIN3  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.812862) with  --  AT3G63500
150 EBF2  --  interacts with  --  EIN3  --  is modified by  --  CTR1
151 EBF2  --  interacts with  --  EIN3  --  is modified by  --  ATMKK9
152 EBF2  --  is a member of  --  Family84, coding gene  --  is regulated by  --  AIN1
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact