Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node AFB2
Type: Protein GRN ID: np02057 Name: AFB2
Annotation: AFB2 | auxin signaling F-box 2
Gene Locus: AT3G26810
References:
  • Dharmasiri N, Dharmasiri S, Weijers D, Lechner E, Yamada M, Hobbie L, Ehrismann JS, Jürgens G, Estelle M. Plant development is regulated by a family of auxin receptor F box proteins. Dev Cell. 2005 Jul;9(1):109-19. PubMed PMID: 15992545.
 
Pathways: Auxins;  Gibberellins 
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 258311_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 AFB2  --  interacts with  --  AFB1
3 AFB2  --  interacts with  --  AFB3
4 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13
5 AFB2  --  interacts with  --  ASK12; SK12
6 AFB2  --  interacts with  --  BDL
7 AFB2  --  interacts with  --  IAA3
8 AFB2  --  interacts with  --  IAA8
9 AFB2  --  interacts with  --  ATAUX2-27; AUX2-27; IAA5
10 AFB2  --  interacts with  --  IAA31
11 AFB2  --  interacts with  --  IAA28
12 AFB2  --  interacts with  --  IAA29
13 AFB2  --  interacts with  --  AXR2
14 AFB2  --  is the target gene of  --  ath-miR393b
15 AFB2  --  is the target gene of  --  ath-miR393a
16 AFB2  --  is a member of  --  TIR1 family31, coding gene
17 AFB2  --  interacts with  --  AFB1  --  interacts with  --  TIR1
18 AFB2  --  interacts with  --  AFB1  --  interacts with  --  BOI; RING
19 AFB2  --  interacts with  --  AFB1  --  interacts with  --  AT2G42390
20 AFB2  --  interacts with  --  AFB1  --  interacts with  --  RCE1
21 AFB2  --  interacts with  --  AFB1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.918808) with  --  BGAL5
22 AFB2  --  interacts with  --  AFB1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.869815) with  --  AT3G12710
23 AFB2  --  interacts with  --  AFB1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.900916) with  --  YUUCA8
24 AFB2  --  interacts with  --  AFB1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.808083) with  --  ATBZIP61; BZIP61
25 AFB2  --  interacts with  --  AFB1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.812724) with  --  GASA4
26 AFB2  --  interacts with  --  AFB1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.88412) with  --  ATHB-3; ATHB3; HAT7; HB-3
27 AFB2  --  interacts with  --  AFB1  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.29978) with  --  LNG1
28 AFB2  --  interacts with  --  AFB1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.958377) with  --  AT5G19340
29 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AtPP2-A13; PP2-A13
30 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT1G67340
31 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT4G38940
32 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT1G76920
33 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT1G55000
34 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT3G04660
35 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  HS; HWS
36 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AtTLP3; TLP3
37 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT3G03360
38 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT1G30790
39 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT5G63520
40 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT5G52880
41 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT5G51250
42 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT5G45360
43 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  EBF2
44 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  FBX2
45 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AtTLP11; TLP11
46 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT5G15710
47 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT5G03970
48 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT4G39290
49 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT4G39240
50 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT4G29370
51 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  SLY1
52 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT4G19940
53 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT4G17200
54 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  FBW2
55 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT4G05460
56 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT4G02310
57 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT3G62430
58 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT3G57580
59 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT3G48880
60 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT3G46050
61 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT3G44130
62 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT3G26010
63 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT3G24580
64 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT3G21130
65 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT3G19560
66 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT3G18720
67 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT3G17540
68 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT3G16580
69 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT3G13830
70 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT3G13820
71 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT3G06240
72 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT2G44130
73 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT2G44030
74 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  EBF1
75 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AtTLP2; TLP2
76 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT2G17030
77 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT2G14710
78 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AtPP2-B1; PP2-B1
79 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT1G78100
80 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  ATSKP2;2; SKP2B
81 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AtTLP1; TLP1
82 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT1G76830
83 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT1G70590
84 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT1G67190
85 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT1G60570
86 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT1G53790
87 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT1G51550
88 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT1G47340
89 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AtTLP6; TLP6
90 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT1G30920
91 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT1G23780
92 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT1G23390
93 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT1G22220
94 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  ATFBP7; FBP7
95 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  SKP2A
96 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT1G13570
97 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT2G22030
98 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  EDL3
99 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  CPR30
100 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  ATCUL1
101 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  EID1
102 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT5G49610
103 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  AT4G39550
104 AFB2  --  interacts with  --  ASK13; SK13  --  interacts with  --  ADO3; FKF1
105 AFB2  --  interacts with  --  ASK12; SK12  --  interacts with  --  AT1G27340
106 AFB2  --  interacts with  --  ASK12; SK12  --  interacts with  --  AT5G67140
107 AFB2  --  interacts with  --  ASK12; SK12  --  interacts with  --  AT5G39250
108 AFB2  --  interacts with  --  ASK12; SK12  --  interacts with  --  AT5G26960
109 AFB2  --  interacts with  --  ASK12; SK12  --  interacts with  --  AT5G15620
110 AFB2  --  interacts with  --  ASK12; SK12  --  interacts with  --  AT3G59200
111 AFB2  --  interacts with  --  ASK12; SK12  --  interacts with  --  AT3G59150
112 AFB2  --  interacts with  --  ASK12; SK12  --  interacts with  --  FBL17
113 AFB2  --  interacts with  --  ASK12; SK12  --  interacts with  --  SKIP5; SKP5
114 AFB2  --  interacts with  --  ASK12; SK12  --  interacts with  --  AT3G52030
115 AFB2  --  interacts with  --  ASK12; SK12  --  interacts with  --  AT3G16740
116 AFB2  --  interacts with  --  ASK12; SK12  --  interacts with  --  AT2G41170
117 AFB2  --  interacts with  --  ASK12; SK12  --  interacts with  --  AT2G17020
118 AFB2  --  interacts with  --  ASK12; SK12  --  interacts with  --  AtPP2-B7; PP2-B7
119 AFB2  --  interacts with  --  ASK12; SK12  --  interacts with  --  AMR1
120 AFB2  --  interacts with  --  ASK12; SK12  --  interacts with  --  AtPP2-A11; PP2-A11
121 AFB2  --  interacts with  --  ASK12; SK12  --  interacts with  --  AT1G57790
122 AFB2  --  interacts with  --  ASK12; SK12  --  interacts with  --  AT1G23770
123 AFB2  --  interacts with  --  ASK12; SK12  --  interacts with  --  AT1G10780
124 AFB2  --  interacts with  --  ASK12; SK12  --  interacts with  --  AT4G02740
125 AFB2  --  interacts with  --  ASK12; SK12  --  interacts with  --  UFO
126 AFB2  --  interacts with  --  ASK12; SK12  --  interacts with  --  ADO1; FKL2; LKP1; ZTL
127 AFB2  --  interacts with  --  ASK12; SK12  --  interacts with  --  AtPP2-B10; PP2-B10
128 AFB2  --  interacts with  --  BDL  --  regulates the expression of   --  ARF18
129 AFB2  --  interacts with  --  BDL  --  regulates the expression of   --  ARF1; ATARF; ATARF1; ATARFA1A
130 AFB2  --  interacts with  --  BDL  --  interacts with  --  ARF9
131 AFB2  --  interacts with  --  BDL  --  interacts with  --  IAA16
132 AFB2  --  interacts with  --  BDL  --  interacts with  --  AXR3
133 AFB2  --  interacts with  --  BDL  --  interacts with  --  IAA20
134 AFB2  --  interacts with  --  BDL  --  interacts with  --  IAA30
135 AFB2  --  interacts with  --  BDL  --  interacts with  --  IAA9
136 AFB2  --  interacts with  --  BDL  --  interacts with  --  IAA18
137 AFB2  --  interacts with  --  BDL  --  interacts with  --  ARF5
138 AFB2  --  interacts with  --  BDL  --  interacts with  --  ARF7
139 AFB2  --  interacts with  --  BDL  --  interacts with  --  ARF6
140 AFB2  --  interacts with  --  BDL  --  interacts with  --  ARF4
141 AFB2  --  interacts with  --  BDL  --  interacts with  --  ARF11
142 AFB2  --  interacts with  --  BDL  --  interacts with  --  IAA15
143 AFB2  --  interacts with  --  BDL  --  interacts with  --  IAA19
144 AFB2  --  interacts with  --  BDL  --  interacts with  --  IAA13
145 AFB2  --  interacts with  --  BDL  --  interacts with  --  IAA14
146 AFB2  --  interacts with  --  BDL  --  interacts with  --  ATAUX2-11; IAA4
147 AFB2  --  interacts with  --  BDL  --  interacts with  --  ARF8
148 AFB2  --  interacts with  --  BDL  --  is a member of  --  family38, transcription factor interactor and regulator gene
149 AFB2  --  interacts with  --  BDL  --  is a member of  --  IAA3 family34, transcription factor interactor and regulator gene
150 AFB2  --  interacts with  --  IAA3  --  regulates the expression of   --  ATIPT5
151 AFB2  --  interacts with  --  IAA3  --  regulates the expression of   --  ATPIN1 family27, coding gene
152 AFB2  --  interacts with  --  IAA3  --  regulates the expression of   --  ATIPT1 family54, coding gene
153 AFB2  --  interacts with  --  IAA3  --  regulates the expression of   --  ASL18; LBD16
154 AFB2  --  interacts with  --  IAA3  --  is regulated by  --  ARR12
155 AFB2  --  interacts with  --  IAA3  --  is regulated by  --  ARR1
156 AFB2  --  interacts with  --  IAA3  --  interacts with  --  IAA27; PAP2
157 AFB2  --  interacts with  --  IAA3  --  interacts with  --  IAA34
158 AFB2  --  interacts with  --  IAA3  --  interacts with  --  IAA2
159 AFB2  --  interacts with  --  IAA3  --  interacts with  --  TPR3
160 AFB2  --  interacts with  --  IAA3  --  interacts with  --  ATGRX2; CXIP2
161 AFB2  --  interacts with  --  IAA3  --  interacts with  --  AXR5
162 AFB2  --  interacts with  --  IAA3  --  interacts with  --  IAA11
163 AFB2  --  interacts with  --  IAA3  --  interacts with  --  ATGRX4; GRX4
164 AFB2  --  interacts with  --  IAA3  --  interacts with  --  AT1G09500
165 AFB2  --  interacts with  --  IAA3  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)
166 AFB2  --  interacts with  --  IAA3  --  interacts with  --  TPR2
167 AFB2  --  interacts with  --  IAA3  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.810977) with  --  AT4G09890
168 AFB2  --  interacts with  --  IAA8  --  regulates the expression of   --  ARF16
169 AFB2  --  interacts with  --  IAA8  --  regulates the expression of   --  AtTPR2; TPR2
170 AFB2  --  interacts with  --  IAA8  --  interacts with  --  ARF22
171 AFB2  --  interacts with  --  IAA8  --  interacts with  --  ARF20
172 AFB2  --  interacts with  --  IAA8  --  interacts with  --  ARF15
173 AFB2  --  interacts with  --  IAA8  --  interacts with  --  ARF14
174 AFB2  --  interacts with  --  IAA8  --  interacts with  --  IAA10
175 AFB2  --  interacts with  --  IAA8  --  interacts with  --  AFB5
176 AFB2  --  interacts with  --  IAA8  --  interacts with  --  AtHB32; HB32; ZHD14
177 AFB2  --  interacts with  --  ATAUX2-27; AUX2-27; IAA5  --  interacts with  --  IAA33
178 AFB2  --  interacts with  --  ATAUX2-27; AUX2-27; IAA5  --  interacts with  --  ARF10
179 AFB2  --  interacts with  --  ATAUX2-27; AUX2-27; IAA5  --  interacts with  --  IAA32; MEE10
180 AFB2  --  interacts with  --  ATAUX2-27; AUX2-27; IAA5  --  is modified by  --  MPK16
181 AFB2  --  interacts with  --  IAA31  --  interacts with  --  ARF1
182 AFB2  --  interacts with  --  IAA31  --  interacts with  --  ARF12
183 AFB2  --  interacts with  --  IAA28  --  interacts with  --  IAA26; PAP1
184 AFB2  --  interacts with  --  IAA29  --  interacts with  --  ARF17
185 AFB2  --  interacts with  --  IAA29  --  interacts with  --  ATWRKY57; WRKY57
186 AFB2  --  interacts with  --  AXR2  --  interacts with  --  TIR
187 AFB2  --  interacts with  --  AXR2  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.888679) with  --  PKS2
188 AFB2  --  interacts with  --  AXR2  --  is regulated by  --  HY5
189 AFB2  --  is the target gene of  --  ath-miR393b  --  inhibit the expression of  --  AT3G23690
190 AFB2  --  is the target gene of  --  ath-miR393b  --  inhibit the expression of  --  ATWRKY33; WRKY33
191 AFB2  --  is the target gene of  --  ath-miR393b  --  is a member of  --  family36, miRNA or ta-siRNA
192 AFB2  --  is a member of  --  TIR1 family31, coding gene  --  is a member of  --  np2055 complex12
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact