LegumeIP V3: From Models to Crops - An Integrative Gene Discovery Platform for Translational Genomics in Legumes

  • [M. truncatula (gene)]
  • Detail of Experiment mapped on Medicago truncatula A17 MtV4.0

Details

NameCK dependent Rhizobium LCO induced signalling in Medicago truncatula
DescriptionRNAseq analysis of Medicago truncatula WT and Mtcre1 3h post rhizobium LCO application 4 sample with 3 biological replicates each, sequenced in both directions
ContactWageningen University, Laboratory of Molecular Biology
XrefPRJEB7508
Reference
Conditions8
SpeciesMedicago truncatula
Metadata export .CSV   .JSON

Analysis

Mapped Genomes MtrunA17r5.0     MtV4.0    
Expression Analysis Expression Profile /  Differential Expression /  Co-expression

Conditions

Name Genotype Mutation Stage Tissue Treatment Level Time Samples Xref Download alignments
A17_LCO_WT- A17 wild type genotype Susceptible zone E-MTAB-3007:A17 LCO WT002- 3h
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  • A17_LCO_WT-_3
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A17_LCO_WT+ A17 wild type genotype Susceptible zone E-MTAB-3007:A17 LCO WT002+ 3h
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A17_noLCO_WT- A17 wild type genotype Susceptible zone E-MTAB-3007:A17 noLCO WT003- 3h
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A17_noLCO_WT+ A17 wild type genotype Susceptible zone E-MTAB-3007:A17 noLCO WT001+ 3h
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Mtcre1_LCO_WT- A17 Mtcre1 mutant Susceptible zone E-MTAB-3007:Mtcre1 LCO WT003- 3h
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Mtcre1_LCO_WT+ A17 Mtcre1 mutant Susceptible zone E-MTAB-3007:Mtcre1 LCO WT003+ 3h
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Mtcre1_noLCO_WT- A17 Mtcre1 mutant Susceptible zone E-MTAB-3007:Mtcre1 noLCO WT001- 3h
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Mtcre1_noLCO_WT+ A17 Mtcre1 mutant Susceptible zone E-MTAB-3007:Mtcre1 noLCO WT002+ 3h
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