LegumeIP V3: From Models to Crops - An Integrative Gene Discovery Platform for Translational Genomics in Legumes

  • [M. sativa (transcript)]
  • Detail of Experiment mapped on Medicago sativa CADL MsV1NR

Details

NameDrought: Diverse germplasm
Description
ContactMaria Monteros (mjmonteros@noble.org)
Xref
Reference
  • unpublished;
Conditions24
SpeciesMedicago sativa
Metadata export .CSV   .JSON

Analysis

Mapped Genomes MsV1NR    
Expression Analysis Expression Profile /  Differential Expression /  Co-expression

Conditions

Name Genotype Mutation Stage Tissue Treatment Level Time Samples Xref Download alignments
1BRSR PI502521_B 35d Leaf Water Stress;
Rewater 		35d;
14d
  • 1BRSR_1
  • 1BRSR_2
  • 1BRSR_3
.bam    .bai    .csi   
.bam    .bai    .csi   
.bam    .bai    .csi   
1BRWR PI502521_B 35d Leaf Well Watered;
Rewater 		35d;
14d
  • 1BRWR_1
  • 1BRWR_2
  • 1BRWR_3
.bam    .bai    .csi   
.bam    .bai    .csi   
.bam    .bai    .csi   
1BSR PI502521_B 35d Leaf Water Stress;
Initial 		35d;
14d
  • 1BSR_1
  • 1BSR_2
  • 1BSR_3
.bam    .bai    .csi   
.bam    .bai    .csi   
.bam    .bai    .csi   
1BWR PI502521_B 35d Leaf Well Watered;
Initial 		35d;
14d
  • 1BWR_1
  • 1BWR_2
  • 1BWR_3
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.bam    .bai    .csi   
4ARSR PI468054_A 35d Leaf Water Stress;
Rewater 		35d;
14d
  • 4ARSR_1
  • 4ARSR_2
  • 4ARSR_3
.bam    .bai    .csi   
.bam    .bai    .csi   
.bam    .bai    .csi   
4ARWR PI468054_A 35d Leaf Well Watered;
Rewater 		35d;
14d
  • 4ARWR_1
  • 4ARWR_2
  • 4ARWR_3
.bam    .bai    .csi   
.bam    .bai    .csi   
.bam    .bai    .csi   
4ASR PI468054_A 35d Leaf Water Stress;
Initial 		35d;
14d
  • 4ASR_1
  • 4ASR_2
  • 4ASR_3
.bam    .bai    .csi   
.bam    .bai    .csi   
.bam    .bai    .csi   
4AWR PI468054_A 35d Leaf Well Watered;
Initial 		35d;
14d
  • 4AWR_1
  • 4AWR_2
  • 4AWR_3
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.bam    .bai    .csi   
.bam    .bai    .csi   
6ARSR PI467926_A 35d Leaf Water Stress;
Rewater 		35d;
14d
  • 6ARSR_1
  • 6ARSR_2
  • 6ARSR_3
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.bam    .bai    .csi   
6ARWR PI467926_A 35d Leaf Well Watered;
Rewater 		35d;
14d
  • 6ARWR_1
  • 6ARWR_2
  • 6ARWR_3
.bam    .bai    .csi   
.bam    .bai    .csi   
.bam    .bai    .csi   
6ASR PI467926_A 35d Leaf Water Stress;
Initial 		35d;
14d
  • 6ASR_1
  • 6ASR_2
  • 6ASR_3
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.bam    .bai    .csi   
.bam    .bai    .csi   
6AWR PI467926_A 35d Leaf Well Watered;
Initial 		35d;
14d
  • 6AWR_1
  • 6AWR_2
  • 6AWR_3
.bam    .bai    .csi   
.bam    .bai    .csi   
.bam    .bai    .csi   
8CRSR PI467908_C 35d Leaf Water Stress;
Rewater 		35d;
14d
  • 8CRSR_1
  • 8CRSR_2
  • 8CRSR_3
.bam    .bai    .csi   
.bam    .bai    .csi   
.bam    .bai    .csi   
8CRWR PI467908_C 35d Leaf Well Watered;
Rewater 		35d;
14d
  • 8CRWR_1
  • 8CRWR_2
  • 8CRWR_3
.bam    .bai    .csi   
.bam    .bai    .csi   
.bam    .bai    .csi   
8CSR PI467908_C 35d Leaf Water Stress;
Initial 		35d;
14d
  • 8CSR_1
  • 8CSR_2
  • 8CSR_3
.bam    .bai    .csi   
.bam    .bai    .csi   
.bam    .bai    .csi   
8CWR PI467908_C 35d Leaf Well Watered;
Initial 		35d;
14d
  • 8CWR_1
  • 8CWR_2
  • 8CWR_3
.bam    .bai    .csi   
.bam    .bai    .csi   
.bam    .bai    .csi   
ARRSR Archer FD5 35d Leaf Water Stress;
Rewater 		35d;
14d
  • ARRSR_1
  • ARRSR_2
  • ARRSR_3
.bam    .bai    .csi   
.bam    .bai    .csi   
.bam    .bai    .csi   
ARRWR Archer FD5 35d Leaf Well Watered;
Rewater 		35d;
14d
  • ARRWR_1
  • ARRWR_2
  • ARRWR_3
.bam    .bai    .csi   
.bam    .bai    .csi   
.bam    .bai    .csi   
ARSR Archer FD5 35d Leaf Water Stress;
Initial 		35d;
14d
  • ARSR_1
  • ARSR_2
  • ARSR_3
.bam    .bai    .csi   
.bam    .bai    .csi   
.bam    .bai    .csi   
ARWR Archer FD5 35d Leaf Well Watered;
Initial 		35d;
14d
  • ARWR_1
  • ARWR_2
  • ARWR_3
.bam    .bai    .csi   
.bam    .bai    .csi   
.bam    .bai    .csi   
B8RSR Bulldog 805 35d Leaf Water Stress;
Rewater 		35d;
14d
  • B8RSR_1
  • B8RSR_2
  • B8RSR_3
.bam    .bai    .csi   
.bam    .bai    .csi   
.bam    .bai    .csi   
B8RWR Bulldog 805 35d Leaf Well Watered;
Rewater 		35d;
14d
  • B8RWR_1
  • B8RWR_2
  • B8RWR_3
.bam    .bai    .csi   
.bam    .bai    .csi   
.bam    .bai    .csi   
B8SR Bulldog 805 35d Leaf Water Stress;
Initial 		35d;
14d
  • B8SR_1
  • B8SR_2
  • B8SR_3
.bam    .bai    .csi   
.bam    .bai    .csi   
.bam    .bai    .csi   
B8WR Bulldog 805 35d Leaf Well Watered;
Initial 		35d;
14d
  • B8WR_1
  • B8WR_2
  • B8WR_3
.bam    .bai    .csi   
.bam    .bai    .csi   
.bam    .bai    .csi